Файл: Отчет о работе биолога лаборатории особо опасных, вирусных и других природноочаговых инфекций.doc
Добавлен: 26.10.2023
Просмотров: 802
Скачиваний: 15
ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.
горизонтальный электрофорез в агарозном геле, гибридизационно-флуоресцентная детекция по конечной точке и в режиме реального времени.
VII. Производственная деятельность
7.1 Сравнительная характеристика методов исследования.
В лаборатории за 2018-2023 годы проведено 291159 исследования на особо опасные и другие природно-очаговые инфекции.
Исследования проводились с диагностической, профилактической целью и по эпидемиологическим показаниям, доставлялся материал от людей и из различных объектов окружающей среды (вода, смывы, мелкие млекопитающие, клещи из природных очагов, клещи, снятые с людей и др. ООС). Исследования проводились серологическим, бактериологическим и молекулярно-генетическим (ПЦР) методами (таблица № 1). За период 2018-2023 гг. в лабораторной практике исследований на природно-очаговые инфекции (ПОИ) наряду с классическими методами широко использовался один из молекулярно-генетических методов – полимеразно-цепная реакция (ПЦР).
Таблица № 1
Объем и структура лабораторных исследований на особо опасные и другие природно-очаговые инфекции
Год | Число исследо-ваний | Бактериологических | Серологических | ПЦР | ||||||
всего | клин.материал | мате-риал из ООС | всего | клин.материал | мате-риал из ООС | всего | клин.материал | мате-риал из ООС | ||
2018 | 28537 | 1345 | 73 | 1269 | 1827 | 1387 | 440 | 11098 | 7267 | 3831 |
2019 | 46874 | 3483 | 25 | 3458 | 3383 | 2559 | 824 | 16571 | 9727 | 6844 |
2020 | 77794 | 2056 | 22 | 2034 | 3308 | 2421 | 887 | 33533 | 21849 | 11684 |
2021 | 50086 | 2322 | 28 | 2294 | 3262 | 2156 | 1106 | 19459 | 14961 | 4498 |
2022 | 53352 | 2120 | 34 | 2086 | 3203 | 2282 | 921 | 21353 | 17293 | 4060 |
2023 (6 месяцев) | 34516 | 1893 | 21 | 1872 | 1512 | 1154 | 358 | 13853 | 4242 | 9611 |
ПЦР - метод молекулярной диагностики, ставший для ряда инфекций «золотым стандартом», проверен временем и тщательно апробирован клинически. Метод ПЦР позволяет определить наличие возбудителя заболевания, даже если в пробе присутствует всего несколько молекул ДНК возбудителя.
К преимуществам ПЦР диагностики можно уверенно отнести ее безусловную универсальность. PCR обнаруживает тип ДНК/РНК даже при неэффективности других методов. При этом в медицинской лаборатории используют универсальное оборудование, независящее от вида генетического материала и разновидности вируса, который предстоит найти. В числе прочих плюсов:
-
Высокая специфичность метода, достигающая 100%. В исследуемом биологическом образце удается выявить уникальную последовательность нуклеотидов, сопряженную с возбудителем. Полученный материал можно исследовать одновременно на наличие нескольких возбудителей без снижения качества результата диагностики; -
Высокий уровень чувствительности. ПЦР-тест позволяет выявить конкретного возбудителя, даже если в пробнике присутствует только одиночная молекула ДНК/РНК; -
Оперативность. Чтобы установить реакцию, достаточно 3-4 часов. Получить результаты лабораторной диагностики пациент может в течение 1-2 дней после сдачи биологического материала; -
Эффективность. ПЦР выявляет некультивируемые, трудно культивируемые и латентно «обитающие» формы патогенных организмов. Однако полимеразная цепная реакция может обозначить только провокатора заболевания, но не реакцию на его контакт с организмом человека; -
Возможность проведения количественного анализа.
В 2018-2023 годах методом ПЦР было проведено 40528 исследований проб из объектов окружающей среды на вирусные, особо опасные и другие бактериальные инфекции. Структура исследований, удельный вес положительных результатов представлен в таблице №2.
Таблица № 2
Структура исследований методом ПЦР объектов окружающей среды.
Год | 2018 | 2019 | 2020 | Всего иссл. | С «+» рез. | Уд. вес | ||||||
Перечень иссл. | всего | + рез. | Уд. вес | всего | + рез. | Уд. вес | всего | + рез. | Уд. вес | |||
Вирусные инфекции | 3045 | 616 | 20,3 | 4536 | 369 | 8,1 | 7542 | 418 | 5,6 | 15123 | 1403 | 9,3 |
Особо опасные и др. бактер. инфекции | 786 | 30 | 3,8 | 2308 | 155 | 6,7 | 4142 | 95 | 2,3 | 7236 | 280 | 3,9 |
Год | 2021 | 2022 | 2023 (6 месяцев) | Всего иссл. | С «+» рез. | Уд. вес | ||||||
Перечень иссл. | всего | + рез. | Уд. вес | всего | + рез. | Уд. вес | всего | + рез. | Уд. вес | |||
Вирусные инфекции | 3542 | 511 | 14,5 | 1622 | 257 | 15,8 | 3469 | 213 | 6,1 | 8633 | 981 | 11,4 |
Особо опасные и др. бактер. инфекции | 956 | 26 | 2,7 | 2438 | 106 | 4,3 | 6142 | 19 | 0,3 | 9536 | 157 | 1,7 |
В 2018-2023 годах было проведено методом ПЦР 75339 исследований проб клинического материала на вирусные, особо опасные и другие бактериальные инфекции. Структура исследований, удельный вес положительных результатов представлен в таблице № 3.
Таблица № 3
Структура исследований клинического материала методом ПЦР
Год | 2018 | 2019 | 2020 | Всего иссл. | С «+» резуль-татом | Уд.вес | ||||||
Перечень иссл. | всего | + рез. | Уд.вес | всего | + рез. | Уд.вес | всего | + рез. | Уд.вес | |||
Вирусные инфекции | 7072 | 465 | 6,6 | 9417 | 591 | 6,3 | 21789 | 962 | 4,4 | 38278 | 2018 | 5,3 |
Особо опасные и др. бактер. инфекции | 195 | 36 | 18,5 | 310 | 66 | 21,3 | 60 | 12 | 4,2 | 565 | 114 | 20,1 |
всего | 7267 | 501 | 6,9 | 9727 | 657 | 6,8 | 21849 | 987 | 4,5 | 38843 | 2132 | 5,4 |
Год | 2021 | 2022 | 2023 (6 месяцев) | Всего иссл. | С «+» резуль-татом | Уд. вес | ||||||
Перечень иссл. | всего | + рез. | Уд.вес | всего | + рез. | Уд.вес | всего | + рез. | Уд.вес | |||
Вирусные инфекции | 14856 | 721 | 4,9 | 17123 | 697 | 4,1 | 4158 | 231 | 5,6 | 36137 | 1649 | 4,5 |
Особо опасные и др. бактер. инфекции | 105 | 15 | 14,2 | 170 | 27 | 15,8 | 84 | 16 | 19,0 | 359 | 58 | 16,1 |
всего | 14961 | 501 | 3,4 | 17293 | 657 | 3,8 | 4242 | 247 | 5,8 | 36496 | 1762 | 4,8 |
7.2 Инфекции, передающиеся кровососущими членистоногими.
Исследовали зараженность возбудителями трансмиссивных клещевых инфекций людей и иксодовых клещей в эпидемические сезоны 2018–2023 гг. на территориях природных очагов Забайкальского края. Оценка активности и распространенности возбудителей клещевых инфекций получена при анализе зараженности иксодовых клещей, собранных с растительности, присосавшихся клещей, снятых с людей. С помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени было показано существование территории Забайкальского края четырёх возбудителей «клещевых» инфекций: клещевого энцефалита, клещевого боррелиоза, гранулоцитарного анаплазмоза, моноцитарного эрлихиоза. Чаще всего в иксодовых клещах обнаруживались боррелии. Единичными были находки генетических маркеров вируса клещевого энцефалита, анаплазм и эрлихий.
Материал проверяли на наличие ДНК/РНК вируса клещевого энцефалита, Borrelia burgdorferi sensu lato, Anaplasma phagocytophilum, Ehrlichia muris / Ehrlichia сhaffeensis методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с использованием набора «Ампли‑ Сенс TBEV, согласно инструкции производителя на амплификаторе с флуоресцентной детекцией ROTOR-GENE Q (QIAGEN, Германия).
Материал для исследования доставляют из г. Чита и 26 районов края. Исследования в лаборатории проводятся согласно плана эпидемиологического мониторинга за возбудителями природно-очаговых инфекций Управления Роспотребнадзора по Забайкальскому краю.
Исследования проводились методом ПЦР, результаты представлены в таблице № 4.
Таблица № 4
Объем и структура исследований ООС на инфекции, передающиеся кровососущими членистоногими методом ПЦР
Наименование_инфекции__Год__2018'>Наименование инфекции | Год | ||||||||
2018 | 2019 | 2020 | |||||||
Всего иссл. | С «+» рез. | Уд. вес | Всего иссл. | С «+» рез. | Уд. вес | Всего иссл. | С «+» рез. | Уд. вес | |
Клещ.энцефалит | 2304 | 306 | 13,3 | 2455 | 243 | 9,9 | 2576 | 246 | 9,6 |
ГАЧ | 2304 | 10 | 0,4 | 2455 | 18 | 0,7 | 2576 | 20 | 0,8 |
МЭЧ | 2304 | 14 | 0,6 | 2455 | 31 | 1,3 | 2576 | 33 | 1,3 |
Боррелиоз | 2304 | 39 | 1,7 | 2455 | 62 | 2,5 | 2576 | 70 | 2,7 |
Наименование инфекции | Год | ||||||||
2021 | 2022 | 2023 (6 месяцев) | |||||||
Всего иссл. | С «+» рез. | Уд. вес | Всего иссл. | С «+» рез. | Уд. вес | Всего иссл. | С «+» рез. | Уд. вес | |
Клещ.энцефалит | 2632 | 223 | 8,4 | 2598 | 251 | 9,7 | 1785 | 32 | 17,1 |
ГАЧ | 2632 | 12 | 0,4 | 2598 | 15 | 0,5 | 1785 | 8 | 0,4 |
МЭЧ | 2632 | 21 | 0,7 | 2598 | 26 | 1,0 | 1785 | 18 | 1,0 |
Боррелиоз | 2632 | 42 | 1,6 | 2598 | 55 | 2,1 | 1785 | 35 | 1,9 |