Файл: Отчет о работе биолога лаборатории особо опасных, вирусных и других природноочаговых инфекций.doc

ВУЗ: Не указан

Категория: Отчет по практике

Дисциплина: Не указана

Добавлен: 26.10.2023

Просмотров: 802

Скачиваний: 15

ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.


горизонтальный электрофорез в агарозном геле, гибридизационно-флуоресцентная детекция по конечной точке и в режиме реального времени.
VII. Производственная деятельность

7.1 Сравнительная характеристика методов исследования.

В лаборатории за 2018-2023 годы проведено 291159 исследования на особо опасные и другие природно-очаговые инфекции.

Исследования проводились с диагностической, профилактической целью и по эпидемиологическим показаниям, доставлялся материал от людей и из различных объектов окружающей среды (вода, смывы, мелкие млекопитающие, клещи из природных очагов, клещи, снятые с людей и др. ООС). Исследования проводились серологическим, бактериологическим и молекулярно-генетическим (ПЦР) методами (таблица № 1). За период 2018-2023 гг. в лабораторной практике исследований на природно-очаговые инфекции (ПОИ) наряду с классическими методами широко использовался один из молекулярно-генетических методов – полимеразно-цепная реакция (ПЦР).
Таблица № 1

Объем и структура лабораторных исследований на особо опасные и другие природно-очаговые инфекции



Год


Число исследо-ваний

Бактериологических

Серологических

ПЦР

всего

клин.материал


мате-риал из ООС

всего

клин.материал


мате-риал из ООС

всего

клин.материал


мате-риал из ООС

2018

28537

1345

73

1269

1827

1387

440

11098

7267

3831

2019

46874

3483

25

3458

3383

2559

824

16571

9727

6844

2020

77794

2056

22

2034

3308

2421

887

33533

21849

11684

2021

50086

2322

28

2294

3262

2156

1106

19459

14961

4498

2022

53352

2120

34

2086

3203

2282

921

21353

17293

4060

2023

(6 месяцев)

34516

1893

21

1872

1512

1154

358

13853

4242

9611



ПЦР - метод молекулярной диагностики, ставший для ряда инфекций «золотым стандартом», проверен временем и тщательно апробирован клинически. Метод ПЦР позволяет определить наличие возбудителя заболевания, даже если в пробе присутствует всего несколько молекул ДНК возбудителя.

К преимуществам ПЦР диагностики можно уверенно отнести ее безусловную универсальность. PCR обнаруживает тип ДНК/РНК даже при неэффективности других методов. При этом в медицинской лаборатории используют универсальное оборудование, независящее от вида генетического материала и разновидности вируса, который предстоит найти. В числе прочих плюсов:

  • Высокая специфичность метода, достигающая 100%. В исследуемом биологическом образце удается выявить уникальную последовательность нуклеотидов, сопряженную с возбудителем. Полученный материал можно исследовать одновременно на наличие нескольких возбудителей без снижения качества результата диагностики;

  • Высокий уровень чувствительности. ПЦР-тест позволяет выявить конкретного возбудителя, даже если в пробнике присутствует только одиночная молекула ДНК/РНК;

  • Оперативность. Чтобы установить реакцию, достаточно 3-4 часов. Получить результаты лабораторной диагностики пациент может в течение 1-2 дней после сдачи биологического материала;

  • Эффективность. ПЦР выявляет некультивируемые, трудно культивируемые и латентно «обитающие» формы патогенных организмов. Однако полимеразная цепная реакция может обозначить только провокатора заболевания, но не реакцию на его контакт с организмом человека;

  • Возможность проведения количественного анализа.

В 2018-2023 годах методом ПЦР было проведено 40528 исследований проб из объектов окружающей среды на вирусные, особо опасные и другие бактериальные инфекции. Структура исследований, удельный вес положительных результатов представлен в таблице №2.

Таблица № 2

Структура исследований методом ПЦР объектов окружающей среды.


Год

2018

2019

2020

Всего иссл.

С «+» рез.

Уд. вес

Перечень иссл.

всего

+ рез.

Уд. вес


всего

+ рез.

Уд. вес


всего

+ рез.

Уд. вес


Вирусные инфекции

3045

616

20,3

4536

369

8,1

7542

418

5,6

15123

1403

9,3

Особо опасные и др. бактер. инфекции

786

30

3,8

2308

155

6,7

4142

95

2,3

7236

280

3,9





Год

2021

2022

2023 (6 месяцев)

Всего иссл.

С «+» рез.

Уд. вес

Перечень иссл.

всего

+ рез.

Уд. вес


всего

+ рез.

Уд. вес


всего

+ рез.

Уд. вес


Вирусные инфекции

3542

511

14,5

1622

257

15,8

3469

213

6,1

8633

981

11,4

Особо опасные и др. бактер. инфекции

956

26

2,7

2438

106

4,3

6142

19

0,3

9536

157

1,7


В 2018-2023 годах было проведено методом ПЦР 75339 исследований проб клинического материала на вирусные, особо опасные и другие бактериальные инфекции. Структура исследований, удельный вес положительных результатов представлен в таблице № 3.

Таблица № 3


Структура исследований клинического материала методом ПЦР


Год

2018

2019

2020

Всего иссл.

С «+» резуль-татом

Уд.вес

Перечень иссл.

всего

+ рез.

Уд.вес


всего

+ рез.

Уд.вес


всего

+ рез.

Уд.вес


Вирусные инфекции

7072

465

6,6

9417

591

6,3

21789

962

4,4

38278

2018

5,3

Особо опасные и др. бактер. инфекции

195

36

18,5

310

66

21,3

60

12

4,2

565

114

20,1

всего

7267

501

6,9

9727

657

6,8

21849

987

4,5

38843

2132

5,4




Год

2021

2022

2023 (6 месяцев)

Всего иссл.

С «+» резуль-татом

Уд.

вес

Перечень иссл.

всего

+ рез.

Уд.вес


всего

+ рез.

Уд.вес


всего

+ рез.

Уд.вес


Вирусные инфекции

14856

721

4,9

17123

697

4,1

4158

231

5,6

36137

1649

4,5

Особо опасные и др. бактер. инфекции

105

15

14,2

170

27

15,8

84

16

19,0

359

58

16,1

всего

14961

501

3,4

17293

657

3,8

4242

247

5,8

36496

1762

4,8



7.2 Инфекции, передающиеся кровососущими членистоногими.

Исследовали зараженность возбудителями трансмиссивных клещевых инфекций людей и  иксодовых клещей в  эпидемические сезоны 2018–2023 гг. на территориях природных очагов Забайкальского края. Оценка активности и распространенности возбудителей клещевых инфекций получена при анализе зараженности иксодовых клещей, собранных с растительности, присосавшихся клещей, снятых с людей. С помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени было показано существование территории Забайкальского края четырёх возбудителей «клещевых» инфекций: клещевого энцефалита, клещевого боррелиоза, гранулоцитарного анаплазмоза, моноцитарного эрлихиоза. Чаще всего в иксодовых клещах обнаруживались боррелии. Единичными были находки генетических маркеров вируса клещевого энцефалита, анаплазм и эрлихий.

Материал проверяли на наличие ДНК/РНК вируса клещевого энцефалита, Borrelia burgdorferi sensu lato, Anaplasma phagocytophilum, Ehrlichia muris / Ehrlichia сhaffeensis методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с использованием набора «Ампли‑ Сенс TBEV, согласно инструкции производителя на амплификаторе с флуоресцентной детекцией ROTOR-GENE Q (QIAGEN, Германия).

Материал для исследования доставляют из г. Чита и 26 районов края. Исследования в лаборатории проводятся согласно плана эпидемиологического мониторинга за возбудителями природно-очаговых инфекций Управления Роспотребнадзора по Забайкальскому краю.

Исследования проводились методом ПЦР, результаты представлены в таблице № 4.

Таблица № 4

Объем и структура исследований ООС на инфекции, передающиеся кровососущими членистоногими методом ПЦР


Наименование_инфекции__Год__2018'>Наименование

инфекции

Год

2018

2019

2020

Всего иссл.

С «+» рез.

Уд. вес

Всего иссл.

С «+» рез.

Уд. вес

Всего иссл.

С «+» рез.

Уд. вес

Клещ.энцефалит

2304

306

13,3

2455

243

9,9

2576

246

9,6

ГАЧ

2304

10

0,4

2455

18

0,7

2576

20

0,8

МЭЧ

2304

14

0,6

2455

31

1,3

2576

33

1,3

Боррелиоз

2304

39

1,7

2455

62

2,5

2576

70

2,7


Наименование

инфекции

Год

2021

2022

2023 (6 месяцев)

Всего иссл.

С «+» рез.

Уд. вес

Всего иссл.

С «+» рез.

Уд. вес

Всего иссл.

С «+» рез.

Уд. вес

Клещ.энцефалит

2632

223

8,4

2598

251

9,7

1785

32

17,1

ГАЧ

2632

12

0,4

2598

15

0,5

1785

8

0,4

МЭЧ

2632

21

0,7

2598

26

1,0

1785

18

1,0

Боррелиоз

2632

42

1,6

2598

55

2,1

1785

35

1,9