Файл: Lection03.pdf

Ëåêöèÿ 3. Áàíêè áèîëîãè÷åñêèõ äàííûõ è ôîðìàòû äàííûõ

Ëåêöèÿ 3.

Áàíêè áèîëîãè÷åñêèõ äàííûõ è ôîðìàòû

äàííûõ

Øèøêèíà Ý. Ë.

Âîðîíåæñêèé ãîñóäàðñòâåííûé óíèâåðñèòåò

30 ñåíòÿáðÿ 2014 ã.

Ëåêöèÿ 3. Áàíêè áèîëîãè÷åñêèõ äàííûõ è ôîðìàòû äàííûõ

GenBank

Îñíîâíûì èñòî÷íèêîì ãåíåòè÷åñêèõ äàííûõ íà äàííûé ìîìåíò

ÿâëÿåòñÿ ìåæäóíàðîäíàÿ áàçà äàííûõ GenBank. Áàçà äàííûõ

îòêðûòà äëÿ âñåõ è ïîçâîëÿåò îñóùåñòâëÿòü è çàãðóçêó è

âûãðóçêó äàííûõ âñåìè ïîëüçîâàòåëÿìè. Äëÿ ïîèñêà è

ïîëó÷åíèÿ äàííûõ ðåãèñòðàöèÿ íåîáÿçàòåëüíà.

Ëåêöèÿ 3. Áàíêè áèîëîãè÷åñêèõ äàííûõ è ôîðìàòû äàííûõ

GenBank

Ðèñ. 1. Áàçû áèîëîãè÷åñêèõ ïîñëåäîâàòåëüíîñòåé.

Ëåêöèÿ 3. Áàíêè áèîëîãè÷åñêèõ äàííûõ è ôîðìàòû äàííûõ

GenBank

Àäðåñ:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/

GenBank  áàçà äàííûõ ãåíåòè÷åñêèõ ïîñëåäîâàòåëüíîñòåé,

ïîääåðæèâàåòñÿ NIH (Íàöèîíàëüíûé Èíñòèòóò Çäîðîâüÿ

ÑØÀ), àííîòèðîâàííàÿ áàçà èçâåñòíûõ ïîñëåäîâàòåëüíîñòåé

ÄÍÊ, ÐÍÊ è áåëêîâ, ñ ëèòåðàòóðíûìè ññûëêàìè íà

ïåðâîèñòî÷íèêè è èíôîðìàöèåé áèîëîãè÷åñêîãî õàðàêòåðà.

Ëåêöèÿ 3. Áàíêè áèîëîãè÷åñêèõ äàííûõ è ôîðìàòû äàííûõ

Îáíîâëÿåòñÿ êàæäûå äâà ìåñÿöà. ßâëÿåòñÿ ÷àñòüþ International

Nucleotide Sequence Database Collaboration, êîòîðàÿ îáúåäèíÿåò

òðè êðóïíåéøèå êîëëåêöèè íóêëåîòèäíûõ ïîñëåäîâàòåëüíîñòåé:

DDBJ (NIG), EMBL (EBI) è GenBank (NCBI).