Файл: Руководство к практическим занятиям_формат.doc

ВУЗ: Не указан

Категория: Не указан

Дисциплина: Не указана

Добавлен: 12.03.2024

Просмотров: 561

Скачиваний: 2

ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.

СОДЕРЖАНИЕ

Руководство к практическим занятиям по генетике и биометрии

Основы биометрии

Методы группировки цифрового материала

Среднее значение признака и методы вычисления этой величины

Показатели изменчивости признаков

5. Схема вычисления среднего квадратического отклонения для малой выборки

6. Схема вычисления среднего квадратического отклонения для большой выборки

Задания для вычисления среднего значения признака и показателей его изменчивости

Статистические ошибки

Критерий достоверности разницы

Критерий соответствия эмпирических и теоретических частот

9. Критические значения критерия (хи-квадрат) Пирсона для

10. Алгоритм вычисление критерия χ2

11. Определение соответствия фактических и теоретических частот методом χ2

Связь между признаками. Коэффициенты корреляции и регрессии

12. Определение коэффициента корреляции методом малой выборки

13. Схема построения корреляционной решетки

14. Связь устойчивости коров к маститу с типом их конституции

1. Удой, кг - жирность молока, %

2. Содержание жира, % - содержание белка, %

3. Удой - количество молочного жира, кг

4. Концентрация уксусной кислоты в рубцовой жидкости -

5. Живая масса - удой, кг

6. Обхват вымени, см - суточный удой, кг

7. Высший суточный удой - удой за лактацию, кг

8.Бактерицидная активность сыворотки крови, % - удой за лактацию, ц

9 Высота коров в холке, см - живая масса, кг

10. Масса бычков при рождении - масса их в 18 месяцев, кг

11. Масса жира "полива" - масса внутреннего жира, кг

12. Масса бычков - масса их туш при убое, кг

13А . Живая масса свиней, кг - обхват груди, см

13. Живая масса свиней, см - толщина шпика, мм

14. Среднесуточный прирост свиней, г - затраты корма, к.Е.

15. Многоплодие, гол. - масса 1 поросенка, кг

16. Живая масса свиноматок - молочность (масса гнезда при отъеме),кг

17. Живая масса овец - настриг шерсти, кг

18. Настриг шерсти, кг - убойный выход овец, %

19. Высота в холке овец, см - живая масса, кг

20. Высота в холке лошадей, см - резвость на дистанции 1600 метров, мин

21. Живая масса кроликов, кг - площадь их шкурок, дм

22. Яйценоскость кур, шт. - масса яиц, г

23. Живая масса кур, кг - яйценоскость, шт.

24. Масса инкубированных яиц - масса суточных цыплят, г

25. Содержание в крови альбуминов, % - масса утят, кг

Дисперсионный анализ

15. Общая схема проведения дисперсионного анализа

Коэффициенты наследуемости и повторяемости признаков

17. Схема вычисления коэффициента повторяемости ранговым методом

Ответы на задачи

Цитологические основы наследственности

Строение и идентификация хромосом

Изучение политенных хромосом в клетках слюнных желез личинки комара

Изучение кариотипов сельскохозяйственных животных

Использование дрозофилы в генетических исследованиях

Моногибридное скрещивание

Закономерности наследования признаков при половом размножении

Моногибридное скрещивание

Сцепленное наследование признаков

Наследование признаков, сцепленных с полом

Молекулярные основы наследственности

Генетика популяций

Определение эффекта гетерозиса

Масса цыплят в возрасте 40 суток, кг

Группы крови и биохимический полиморфизм белков

Геhеалогический анализ

Литература

Содержание

МИНИСТЕРСТВО СЕЛЬСКОГО ХОЗЯЙСТВА

РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

ФГОУ ВПО БЕЛГОРОДСКАЯ ГОСУДАРСТВЕННАЯ

СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННАЯ АКАДЕМИЯ

В.В. ШМАЙЛОВ

Руководство к практическим занятиям по генетике и биометрии

Методическое пособие

Белгород 2008

4 И 8 (03 )

ЛР N 020329

УДК 636.082 (075.8)

В.В.Шмайлов. Руководство к практическим занятиям по генетике сельскохозяйственных животных. 2-е изд., перераб. и доп.

Методическое пособие, 2008.- / Изд.-ство БГСХА.

В руководстве приведены краткие сведения об основных биометрических показателях, методах их вычисления и использования. В него включены лабораторные работы по цитогенетике и гибридологическому анализу. В пособии дано теоретическое обоснование закономерностей наследования признаков при половом размножении, сцепленного наследования признаков, молекулярных основ наследственности и генетических процессов в популяциях.

Для самостоятельной работы студентов в него включено около 250 задач, составленных по материалам племенных книг, исследований сотрудников института и литературных источников по генетике.

Практикум предназначен для проведения лабораторных занятий со студентами факультета технологии животноводства и ветеринарной медицины сельскохозяйственных учебных заведений.

Рецензент: Кулаченко В.П. - доктор биологических наук, профессор

Рекомендовано к изданию учебно-методическим советом факультета технологии животноводства. Протокол N26 от 10 января 2008 года.

© Белгородская государственная сельскохозяйственная академия, 2008

Основы биометрии

В современных условиях специалист в области животноводства должен не только в совершенстве знать технологию и уметь организовать производственный процесс, но и проводить научную работу по испытанию различных пород животных или новых элементов технологий. Для выполнения этих задач он должен методически правильно провести опыт и уметь обобщить и обработать полученные результаты. Кроме этого зооинженеры, технологи и ветеринарные врачи в повседневной работе сталкиваются с массой цифрового материала, который необходимо уметь систематизировать и обработать, чтобы получить объективную информацию. Разобраться в этих вопросах поможет изучение биометрии - науки о применении методов вариационной статистики и теории вероятности для анализа массовых явлений. Биометрия сложилась в пограничных областях между математикой и биологией. Ее развитие связано с превращением биологии из науки описательной в науку точную, основанную на измерениях и на применении количественных оценок при решении биологических задач.


С помощью биометрических методов можно систематизировать и обрабатывать числовые данные, полученные при изучении биологических объектов, определять средние значения признаков и их изменчивость, устанавливать достоверность полученных результатов при сравнении групп животных, выявлять связь между признаками, устанавливать долю влияния того или иного фактора на изменчивость признака и определять другие селекционные параметры.

В настоящее время в связи с внедрением компьютеров и наличием большого числа программ можно довольно быстро вычислить любой из биометрических показателей. Но без знания теоретических основ биометрии невозможно правильно оценить полученные величины и дать им научное объяснение.

Статистический анализ массовых данных находит широкое применение при решении теоретических и практических вопросов генетики, селекции и племенного дела.

Цель этого раздела - дать краткие сведения об основных биометрических показателях, алгоритмах их вычисления и использования. В пособии приводятся также задачи и цифровой материал для самостоятельной статистической обработки.


Методы группировки цифрового материала

Предметом биометрии являются варьирующие (изменяющиеся) признаки у относительно однородной группы живых организмов. Например, в группе животных одной породы, возраста и пола варьирующим признаком может быть живая масса, удой, содержание жира и белка в молоке, клинические показатели и другие признаки. В биометрии такую однородную группу объектов называют  генеральной совокупностью . В нее могут входить все животные какой-либо породы, линии или популяции. Изучить генеральную совокупность по хозяйственно полезным, физиологическим или клиническим признакам очень трудно, а в ряде случаев практически невозможно. Поэтому для изучения основных параметров генеральной совокупности используют выборочное обследование. Выборочная совокупность  или выборка – это часть генеральной совокупности, которая отражает ее свойства и отобрана в случайном порядке. Точное отражение выборкой свойств генеральной совокупности называется  репрезентативностью.

Объем генеральной совокупности в биометрии принято обозначать буквой N, а выборочной - n. Чем больше объем выборки, тем выше ее репрезентативность. Выборка считается малой, если в нее включено 30 или менее членов, и большой при n > 30. Это важно учитывать, так как техника расчетов основных биометрических показателей для большой и малой выборок различна.

Конкретное значение варьирующего признака в биометрии называют вариантой  и обозначают буквой V или X.

Признаки у животных разделяются на качественные и количественные. К качественным относят пол, масть, тип конституции, устойчивость к заболеваниям и др. Количественные признаки отличаются тем, что могут быть измерены и выражены в цифровом значении (удой, живая масса, количество эритроцитов, частота дыхания и др.). Количественная изменчивость может быть дискретной, если признак измеряется целыми числами (многоплодие, яйценоскость, частота пульса), и непрерывной, когда варианты принимают любые значения (масса животных, удой, промеры, концентрация белка и др.).

Полученный при составлении выборочной совокупности цифровой материал для удобства в работе нужно упорядочить. Один из наиболее простых методов систематизации цифрового материала -  ранжирование. Его в основном применяют для малых выборок. При пользовании методом ранжирования варианты располагают строго в порядке их увеличения или уменьшения. В ранжированном ряду легко установить минимальное и максимальное значение признака, а также наиболее часто встречаемое его значение - моду (Мо). Например, при изучении многоплодия крольчих породы шиншилла получены следующие данные: 7, 10, 6, 6, 7, 12, 4, 7, 9, 8. Ранжированный ряд этой выборочной совокупности будет выглядеть так: 4, 6, 6, 7, 7, 7, 8, 9, 10, 12.


Анализ ряда показывает, что минимальное число крольчат в помете - 4, максимальное - 12. Наиболее часто встречаются кролематки, у которых в помете 7 крольчат.

Другой метод упорядочивания цифрового материала - вариационный ряд. Вариационный ряд - это двойной ряд чисел, показывающий распределение вариант по классам. Например, при клиническом обследовании 35 овец получены следующие значения частоты пульса (удары в мин):

76 70 75 75 77 74 74 71 73 73 68 76 74 76 76 75 75 72

71 75 76 79 75 75 74 72 73 75 74 80 73 73 72 71 72

n = 35

Техника построения вариационного ряда сводится к следующему:

1. Находят минимальное (min) и максимальное (max) значения признака и на основании этих величин определяют лимит (lim).

max = 80; min = 68; lim = max - min; lim = 80 - 68 = 12.

2. Исходя из объема выборки и величины изменчивости признака определяют необходимое число классов, которое берут в интервале от 5 до 15. Приблизительно число классов устанавливают по таблице.

  1. Число классов в зависимости от объема выборки (по Лакину)

Объем выборки

Число классов

25 – 40

40 – 60

60 – 100

100 – 200

больше 200

5 – 6

6 – 8

8 – 10

10–12

10–15

В нашем примере возьмем 6 классов.

3. После определения числа классов вычисляют величину классового интервала (i).

lim 12

i = ──────── = ─── = 2 (уд./мин).

число классов 6

4. Далее строят таблицу вариационного ряда и определяют границы классов. Началом первого класса берут минимальное значение признака. Каждый последующий увеличивают на величину классового промежутка. Концом каждого класса берут величину на одну значащую цифру меньше начала последующего. Концом последнего класса является максимальное значение признака.

После установления границ классов разносят варианты. Учитывать частоты вариант можно с помощью различных условных знаков - точек, палочек и т.д. Однако наиболее часто в биометрии применяют следующий шифр:


1 2 3 4 5 6 7 8 9 10

Для приведенного примера вариационный ряд будет иметь следующий вид (табл.2)

  1. Вариационный ряд распределения овец по частоте пульса

Классы

Границы

Частоты

1

2

3

4

5

6

68-69

70-71

72-73

74-75

76-77

78-80

1

4

9

13

6

2

При построении вариационного ряда выявляются закономерности. Обычно при нормальном распределении вариант наибольшие частоты имеют классы, расположенные в середине ряда, к краям частоты вариант постепенно убывают.

Вариационный ряд можно представить также в виде графика или гистограммы.

частота частота

классы классы

График вариационного ряда Гистограмма