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Manuel d’étude et de gestion des oiseaux et de leurs habitats en zones côtières 

 
 

SOMMAIRE 

Préface

Jean-Claude L

EFEUVRE

   

1

-

Avant-propos 

Patrick T

RIPLET

  

5-7

Chapitre I : Écosystèmes estuariens et littoraux 

Les milieux estuariens et littoraux, définitions et fonctionnement 

11- 12

Fernand V

ERGER

La dynamique sédimentaire aux abords des estuaires macrotidaux à mégatidaux 

13-16

Julia B

ASTIDE

Les franges littorales : une dynamique sédimentaire animée par un système de cellules actives 

17-22

Julia B

ASTIDE

Organisation de la végétation littorale des estrans vaseux 

23-59

Chantal B

ONNOT

-C

OURTOIS

 & Jacques-Édouard L

EVASSEUR

Le substrat, base des peuplements   

61-66

Sophie Le D

RÉAN 

Q

UÉNEC

HDU

 & Patrick T

RIPLET

  

Prélever et analyser le sédiment 

67-74

Alain P

ONSERO

, Anthony S

TURBOIS

 & Patrick T

RIPLET

  

Chapitre II : Les invertébrés, proies des limicoles 

Les invertébrés des estrans meubles et rocheux 

85-99

Alain P

ONSERO

 & Anthony S

TURBOIS

Les crustacés, proies des oiseaux   

           

101-102

Mustapha A

KSISSOU

 & Younes S

AOUD

Stratégies d’échantillonnage du benthos 

           

103-106

Alain P

ONSERO

 & Anthony S

TURBOIS

Prélever le macrobenthos   

           

107-111

Alain P

ONSERO

 & Anthony S

TURBOIS

Localiser les stations de prélèvements 

           

113-117

Alain P

ONSERO

 & Anthony S

TURBOIS

Connaître la profondeur d’enfouissement des annélides et des bivalves  

           

119-122

Alain P

ONSERO

, Anthony S

TURBOIS

 & Patrick T

RIPLET

  

Procéder aux mesures des invertébrés benthiques 

           

123-124

Alain P

ONSERO

 & Anthony S

TURBOIS

Déterminer la biomasse des individus 

           

125-129

Alain P

ONSERO

, Anthony S

TURBOIS

 & Patrick T

RIPLET

  

Traiter les données 

           

131-136

Alain P

ONSERO

 & Anthony S

TURBOIS

Établir une cartographie des espèces benthiques 

          

137-141

Patrick T

RIPLET

, Stéphanie V

ILAIN

 & Alain P

ONSERO

 
 
 


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Chapitre III : Les habitats végétalisés 

Les marais salés littoraux   

            

157-207

Antoine M

EIRLAND

,

Olivier C

HABRERIE

 & Audrey B

OUVET

Cartographie la végétation des marais maritimes 

            

209-214

Anthony S

TURBOIS

 & Frédéric B

IORET

Cartographie des espèces et des habitats : application à la baie de Somme 

            

215-216

Antoine M

EIRLAND

 & Olivier C

HABRERIE

Mesurer la pression de pâturage sur les prés-salés 

            

217-221

Patrick T

RIPLET

  

Chapitre IV :

Canards, oies et bernaches

  

 
Principales caractéristiques biologiques en zone côtière 

            

235-249

Vincent S

CHRICKE

, Matthieu G

UILLEMAIN

, Maud P

OISBLEAU

 & Daphné

D

URANT

Étudier le comportement alimentaire 

            

251-264

Matthieu G

UILLEMAIN

, Vincent S

CHRICKE

, Maud P

OISBLEAU

 & Daphné D

URANT

Déterminer le régime alimentaire   

            

265-268

Matthieu G

UILLEMAIN

, Vincent S

CHRICKE

, Maud P

OISBLEAU

 & Daphné D

URANT

Déterminer les besoins énergétiques 

            

269-272

Matthieu G

UILLEMAIN

, Vincent S

CHRICKE

, Maud P

OISBLEAU

 & Daphné D

URANT

Marquer individuellement les oies, bernaches et canards 

            

273-275

Matthieu G

UILLEMAIN

, Vincent S

CHRICKE

, Maud P

OISBLEAU

 & Daphné D

URANT

Chapitre V : Limicoles  

Principales caractéristiques biologiques en zone côtière 

            

287-310

Patrick T

RIPLET

 & Sophie Le D

RÉAN 

Q

UÉNEC

HDU

Quantifier les besoins énergétiques des limicoles 

            

311-320 

Alain P

ONSERO

, Patrick Le M

AO

, Pascal H

ACQUEBART

, Mickaël J

AFFRE

, Laurent G

ODET

Prendre en compte les surfaces réellement exploitables 

            

321-330

Alain P

ONSERO

, Patrick Le M

AO

, Pascal H

ACQUEBART

, Mickaël J

AFFRE

, Laurent G

ODET

Mesurer le rythme de captures 

            

331-335

Patrick T

RIPLET

  

Quantifier la consommation de coques par les Huîtriers pies   

            

337-339

Patrick T

RIPLET

  

Recenser une population nicheuse   

            

341-345

Patrick T

RIPLET

  

Chapitre VI : Autres espèces 

Laridés   

            

363-366

François S

UEUR

Analyse de la pression de dérangement exercée sur une colonie de Sternes pierregarin 

Sterna hirundo     

367-371

Yann T

URGIS

  

Suivi des sites d’alimentation des Sternes pierregarin  

           

373-376

Yann T

URGIS

Passereaux 

           

377-398

Marie-Christine E

YBERT


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Chapitre VII : Mettre en place des études appliquées 

Dérangement de l’avifaune : croiser étude de fréquentation et suivi naturaliste dans le cadre d’un outil d’aide à la 

gestion 

            407-448 

Nicolas Le C

ORRE

, Louis B

RIGAND

, Guillaume G

ÉLINAUD

 & Solenn Le B

ERRE

Établir une enquête fréquentation : l’exemple de la Réserve naturelle nationale de la baie de Somme       449-457 

Faustine S

IMON

Définir, analyser et prendre en compte les dérangements dans la gestion d’un site 

           459-474 

Patrick T

RIPLET

, Sophie Le D

RÉAN 

Q

UÉNEC

HDU

 & Faustine S

IMON

Déterminer les réactions aux dérangements chez les anatidés   

           475-477 

Matthieu G

UILLEMAIN

, Vincent S

CHRICKE

, Maud P

OISBLEAU

 & Daphné D

URANT

Les modèles comportementaux appliqués aux oiseaux côtiers  

           479-518 

Richard S

TILLMAN

 &  John G

OSS

-C

USTARD

Données requises pour l’utilisation du modèle M

ORPH

             

519-526 

Stéphanie V

ILAIN

Chapitre VIII : Améliorer l’utilisation des milieux 

Définir et utiliser la capacité d’accueil des oiseaux migrateurs  

           

545-560

John G

OSS

-C

USTARD

Sauvegarder les oiseaux nicheurs en haut de plage   

            

561-570

Patrick T

RIPLET

  

Contrôler les prédateurs   

            

571-578

Patrick T

RIPLET

 & Philippe C

ARRUETTE

Gérer le développement de la Spartine anglaise 

            

579-601

Patrick T

RIPLET

 & Julia B

ASTIDE

Apporter des solutions au développement du Chiendent maritime 

            

603-612

Vincent S

CHRICKE

 & Loïc V

ALÉRY

Chapitre IX : Menaces et risques sur les oiseaux et leurs habitats 

 
Introduction 

            

633-635

Sophie Le D

RÉAN 

Q

UENÉC

HDU

Pollutions aigues et chroniques : zones à risques, gestion 

            

637-643

Sophie Le D

RÉAN 

Q

UÉNEC

HDU

Impact des parasites sur les oiseaux 

            

645-654

Sophie Le D

RÉAN 

Q

UÉNEC

HDU

Méthodes d’étude des parasites et de leur impact 

            

655-658

Sophie Le D

RÉAN 

Q

UÉNEC

HDU

Epizooties, risques, prévention et gestion 

            

659-668

Sophie Le D

RÉAN 

Q

UÉNEC

HDU

Portage latent d’agents pathogènes par les oiseaux d’eau 

            

669-675

Sophie Le D

RÉAN 

Q

UÉNEC

HDU

 
 
 
 
 
 
 



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Manuel d’étude et de gestion des oiseaux et de leurs habitats en zones côtières, 2012 

Préface

 
 

Jean-Claude L

EFEUVRE

1

Lorsque l’on s’intéresse aux oiseaux, comme c’est mon cas, un bon-

heur n’arrive jamais seul : l’année où la Ligue pour la protection des oiseaux 
me décerne le « Macareux d’or », Patrick Triplet me demande de préfacer un 
ouvrage  collectif  conçu  par  lui  et  effectué  sous  sa  direction.  À  noter  qu’il 
n’en est pas à son coup d’essai puisqu’il a déjà réalisé un ouvrage similaire 
(et  apprécié)  sur  les  aires  protégées  africaines.  J’ai  accepté  d’autant  plus 
facilement qu’un tel manuel est devenu une nécessité compte tenu de la mul-
tiplicité  des  organismes  qui  ont  ou  auront  en  charge  de  tels  espaces  et  de-
vront  tout  faire,  sur  des  bases  scientifiques  solides,  pour  protéger  des  com-
plexes  d’habitats  nécessaires  à  l’expression  de  l’ensemble  des  comporte-
ments  des  oiseaux  autochtones,  et  aux  migrateurs  lors  d’étapes  migratoires 
ou en hivernage, en tant qu’aires de repos et lieux de nourrissage 

 
Pour  cela,  il  fallait  réunir  des  compétences  utiles  et  variées.  C’est 

chose  faite  et  je  le  dis  d’autant  plus  sincèrement  que  je  connais  nombre 
d’intervenants  et  que  j’ai  pu  apprécier  leur  travail.  Actuellement,  on  parle 
beaucoup  de  services  rendus  par  les  écosystèmes,  par  les  milieux  naturels. 
J’ai envie de dire que les ornithologues ont ceci de particulier qu’ils peuvent 
se vanter d’être aussi ceux qui ont remplacé le « services rendus par les éco-
systèmes » par « services rendus à la nature». On ne peut en effet contester 
que  ces  passionnés  d’oiseaux  ont  si  bien  su  mettre  en  avant  « leur  matériel 
biologique » (un terme que j’utilise en tant que scientifique, que je déteste en 
tant qu’amoureux de la nature) qu’ils ont aidé à convaincre les plus réticents 
qu’il était plus que temps de sauver ce qui reste de naturel sur cette planète. 
Il  est  vrai  que  les  oiseaux  ont  toujours  été  considérés  comme  de  puissants 
symboles permettant de susciter la mobilisation du grand public et des pou-
voirs  décisionnaires  pour  la  conservation  des  milieux  les  plus  menacés. 
Grâce à des amateurs éclairés et à des scientifiques, les oiseaux constituent le 

                                                 

1

 Professeur émérite au Muséum national d’histoire naturelle.