Файл: Коронавирусы.pdf

Коронавирус HKU1 был обнаружен в 2004 году в Гонконге (Woo P.C. et al., 2005). Выделяют три генотипа коронавируса HKU1 – A, B и C; и согласно ряду исследований преобладающими являются генотипы А и В (Gerna G. et al., 2007; Sloots T.P. et al., 2005). Коронавирусная инфекция, вызванная вирусом HKU1, характеризуется ринореей, кашлем, лихорадкой, свистящим дыханием
(Esper F. et al., 2006), может приводить к таким заболеваниям как бронхиты, ларингиты, бронхиолиты и пневмониям, а также обострению астмы (Mahony J.B. et al., 2007).
По данным Всемирной организации здравоохранения в мире регистрируется около 450 миллионов случаев пневмонии в год, что приводит к 4 миллионам смертей. Примерно 200 миллионов всех случаев – это вирусные внебольничные пневмонии, которые вызываются респираторно-синцитиальным вирусом, риновирусами, вирусами гриппа, вирусами парагриппа человека, коронавирусами, метапневмовирусами, бокавирусами и некоторыми энтеровирусами.
Коинфекции двумя или более возбудителями и сопутствующие заболевания часто усложняют первоначальный диагноз и влияют на тяжесть и прогноз заболевания.
Коронавирусы часто встречаются как коинфекция.
Таблица 2. Микст-инфекции с коронавирусами
(
Killerby ME, Biggs HM, Haynes A, et al. Human coronavirus circulation in the United States 2014-2017. J Clin Virol. 2018;101:52‐56. doi:10.1016/j.jcv.2018.01.019)

Долгосрочное системное исследование провели в США, собирая данные о респираторных заболеваний в семьях с детьми в районе города Анн-Арбор, Мичиган (
Arnold S Monto, Peter M DeJonge, Amy
P Callear, Latifa A Bazzi, Skylar B Capriola, Ryan E Malosh, Emily T Martin, Joshua G Petrie, Coronavirus Occurrence and Transmission Over 8
Years in the HIVE Cohort of Households in Michigan, The Journal of Infectious Diseases, , jiaa161, https://doi.org/10.1093/infdis/jiaa161
).
Постоянно, в течение 10 лет, от 890 до 1441 человека в год из нескольких сотен домохозяйств принимали участие в исследовании. В 2010 году было начато отслеживание появления четырех коронавирусов человека (OC43, 229E, HKU1 и NL63). Ученые изучили частоту, сезонность и характеристики передачи в домохозяйствах 993 случаев инфекций, вызванных этими коронавирусами. Обращения к врачам потребовалось примерно в 30% случаев: примерно 9% у взрослых и около 20% − у детей. Исследование проводилось непрерывно круглогодично, большинство случаев коронавируса было выявлено в период с декабря по апрель/май и достигало пика в январе/феврале. Только 2,5% случаев произошли с июня по сентябрь.
Наибольшая частота заражения была у детей в возрасте до пяти лет.
Из 993 случаев инфицирования в 260 заражение происходило от проживающих совместно родных. Промежуток между первым больным в семье и случаями передачи между членами этой семьи (серийный интервал) колебался в диапазоне 3,2-3,6 дня; риск повторного заражения варьировал от 7,2% до 12,6%. Тяжелые случаи с большей вероятностью приходились на детей младше пяти лет и взрослых старшего возраста (50 лет и старше).
Arnold S Monto, Peter M DeJonge, Amy P
Callear, Latifa A Bazzi, Skylar B Capriola, Ryan E Malosh, Emily T Martin, Joshua G Petrie, Coronavirus Occurrence and Transmission Over 8 Years in the HIVE Cohort of Households in Michigan, The Journal of Infectious Diseases, , jiaa161, https://doi.org/10.1093/infdis/jiaa161

Рис. 10. Периоды регистрации случаев коронавирусной инфекции, 2010–2018 годы
(
Arnold S Monto, Peter M DeJonge, Amy P
Callear, Latifa A Bazzi, Skylar B Capriola, Ryan E
Malosh, Emily T Martin, Joshua G Petrie,
Coronavirus Occurrence and Transmission Over
8 Years in the HIVE Cohort of Households in
Michigan, The Journal of Infectious Diseases, , jiaa161, https://doi.org/10.1093/infdis/jiaa161
Рис. 11. Заболеваемость коронавирусными инфекциями на 100 человек/год, 2010–2018 годы. Ошибка представлена с 95%-ным доверительным интервалом
(
Arnold S Monto, Peter M DeJonge, Amy P Callear, Latifa A Bazzi, Skylar B Capriola, Ryan E Malosh, Emily T Martin, Joshua G Petrie,
Coronavirus Occurrence and Transmission Over 8 Years in the HIVE Cohort of Households in Michigan, The Journal of Infectious Diseases, , jiaa161, https://doi.org/10.1093/infdis/jiaa161

В другом исследовании была изучена циркуляция коронавирусов человека в США в 2014-
2017 годах, оно подтвердило периодичность и сезонность заболевания, а также высокий процент коронавирусной инфекции в общем количестве заболеваний ОРВИ.
Рис. 12. Процент положительных тестов на HCoVs-OC43, -NL63, -229E и -HKU1 в США по неделям за период с июля 2014 года по июнь 2017 года.
(Killerby ME, Biggs HM, Haynes A, et al. Human coronavirus circulation in the United States 2014-2017. J Clin Virol. 2018;101:52‐56. doi:10.1016/j.jcv.2018.01.019)
Заболеваемость тяжелым острым респираторным синдромом (ТОРС, SARS)
В ноябре 2002 года в городе Фошань, провинция Гуандун, Китай, были зарегистрированы необычные случаи «атипичной пневмонии» с неизвестной причиной заболевания, при котором заразились многие медицинские работники (
Zhao Z, Zhang F, Xu M, et al. Description and clinical treatment of an early outbreak of severe acute respiratory syndrome (SARS) in Guangzhou, PR China. J Med
Microbiol 2003; 52:715–20
). Через заразившегося там врача, который наблюдал за случаями непонятной пневмонии на материковом Китае, инфекция 21 февраля 2003 года была завезена в
Гонконг, где стала распространяться и привела к последующим вспышкам тяжелой пневмонии, названной ВОЗ 15 марта 2003 года как severe acute respiratory syndrome, тяжелый острый респираторный синдром (SARS, ТОРС). К 22 марта 2003 года было выяснено, что заболевание вызвал новый коронавирус. Вирус был завезен в 31 страну мира, но история эпидемии атипичной пневмонии была короткой, и ВОЗ объявила о прекращении эпидемии атипичной пневмонии уже в июле 2003 года.
Рис. 13. 26-летний посетитель, который
останавливался на 9-м этаже отеля М,
был принят 4 марта 2003 года в больницу
общего профиля 8А с лихорадкой и
пневмонией. Контакты с ним в течение 2
недель привели к заболеванию 138 человек
(включая работников здравоохранения).
Причиной
этого
послужили
переполненные медицинские палаты в
больнице, неадекватные меры защиты
медперсонала, система вентиляции в
больничной палате, не отвечающая
степени
угрозы
от
зараженного

коронавирусом SARS и др.
Вирус SARS был обнаружен в секретах дыхательных путей, моче, фекалиях и выделениях из
слезных
желез
зараженных
SARS-инфекцией.
Анализ
пространственно-временного
распространения инфекции SARS-CoV среди пациентов стационарного отделения 8А в
сочетании с исследованием потоков привело к заключению, что заражение произошло при
передаче вируса по воздуху. Многофакторный анализ смоделированых 1744 сценариев
распространения коронавируса помог обнаружить, что SARS, скорее всего, распространялся в
основном воздушно-капельным путем, в то время как фомиты играли несущественную роль в
передаче
(Xiao S, Li Y, Wong TW, et al. Role of fomites in SARS transmission during the largest hospital outbreak in Hong Kong. PLoS One
2017;12(7):e0181558.).
Фоми́ты (
англ.
fomites)
− любые предметы, контаминированные патогенными микроорганизмами или паразитами, при соприкосновении с которыми возникает риск заражения. Типичными фомитами являются одежда, поверхность кожи, волосы, а также постельные принадлежности в медицинских учреждениях. Гладкие (непористые) поверхности
(например, дверные ручки) передают бактерии и вирусы лучше, чем пористые (например, бумажные купюры).
(
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A4%D0%BE%D0%BC%D0%B8%D1%82%D1%8B
)
Вирус был обнаружен в высоких концентрациях в мокроте (до 100 миллионов на миллилитр) и в более низких концентрациях в крови и фекалиях во время острой фазы. В среднем вирусная нагрузка достигала максимума на 10-й день и снижалась на 15-й день после заражения
(Peiris JSM, Chu CM, ChengVCC et al. Prospective study of the clinical progression and viral load of SARS associated coronavirus pneumonia in a community outbreak (accepted in Lancet and available at: http://www.who.int)).
Клиническая характеристика заболевания средней тяжести протекания проявлялась в поражении верхних и нижних дыхательных путей, регистрировались симптомы респираторного заболевания: лихорадка, сухой кашель, одышка и гипоксия. В нижних отделах легких на рентгенограммах грудной клетки и КТ были видны интерстициальные паттерны. Характеристика поражений на КТ – двусторонняя пневмония с характерным поражением «матовое стекло», имитирующим облитерирующий бронхиолит, переходящий в пневмонию
(Lee N, Hui D, Wu A et al. A major outbreak of severe acute respiratory syndrome in Hong Kong. N Engl
J Med 2003; 348:1986–94; Ksiazek TG, Erdman D, Goldsmith CS et al. A novel coronavirus associated with severe acute respiratory syndrome. N
Engl J Med. 2003; 348:1953–66.)
. Гистологическое исследование легочной ткани от летальных случаев показывала диффузное альвеолярное повреждение, подобное тому, которое наблюдается в ранней фазе острого респираторного дистресс-синдрома (ОРДС). Патологические изменения включали пролиферацию эпителиальных клеток, наличие гигантских клеточных инфильтратов и увеличение количества легочных макрофагов. Гемофагоцитоз, подтверждающий процесс дисрегуляция цитокинов, был продемонстрирован у многих пациентов.
Рис.14. От объявления о глобальной угрозе, сделанной
ВОЗ, до окончания эпидемии SARS прошло около 5 месяцев

Colin R. Parrish, Edward C. Holmes, David M. Morens, Eun-Chung Park, Donald S. Burke, Charles H. Calisher, Catherine A. Laughlin, Linda J. Saif, and Peter DaszakCross-Species Virus Transmission and the Emergence of New Epidemic Diseases Microbiol Mol Biol Rev. 2008 Sep; 72(3):
457–470. doi: 10.1128/MMBR.00004-08
В связи с отсутствием новых случаев инфицирования (прошло 3 недели) 9 мая 2003 года
ВОЗ объявила Китай свободной от атипичной пневмонии. Эпидемия коронавирусной инфекции, вызванной SARS, была завершена.
В последующие годы ни одного случая заражения ТОРС-коронавирусом в мире зарегистрировано не было.
Ситуация с ближневосточным респираторным синдромом (БВРС, MERS)
Коронавирус, вызывающий заболевание ближневосточный респираторный синдром
(MERS), относится к роду Betacoronavirus семейства Coronaviridae и генетически близок к коронавирусам летучих мышей HKU4 и HKU5. Исследования генома БВРС-коронавируса (MERS) и сравнение его с коронавирусами, выделенными из образцов, взятых у верблюдов и летучих мышей, показало, что переход от летучих мышей к верблюдам мог произойти в период с 2007 до
2010 года. Первые случаи заболевания были выявлены в июне 2012 года. Первое сообщение о
БВРС-коронавирусе (MERS) датировано 15 сентября 2012 года, когда в информационной системе
ProMED было сообщено о выявлении этого вируса в образцах от пациента из Саудовской Аравии, умершего в июле 2012 года.
Эпидемия коронавирусной инфекции, вызванной БВРС-коронаавирусом (MERS), была зарегистрирована в 2012 году и продолжается до настоящего времени. С 2012 года случаи MERS за пределами Ближнего Востока были зарегистрированы на всех континентах и были связаны с поездками на Ближний Восток. Большинство случаев заражения регистрируется в Саудовской
Аравии – 80% от всех случаев заболевания людей.
Случаи внутрибольничного заражения составляют примерно 40%; эти случаи произошли в
Саудовской Аравии, Объединенных Арабских Эмиратах (ОАЭ) и Республике Корея. Самая крупная вспышка заболевания за пределами Аравийского полуострова произошла в Республике Корея, она привела к 186 подтвержденным случаям ближневосточного респираторного синдрома с 38 смертельными исходами. Это произошло после возвращения корейского туриста из турне по странам Аравийского полуострова – Катар, ОАЭ, Саудовская Аравия и Бахрейн, после которого он заболел респираторным заболеванием и посетил несколько больниц до окончательного установления 20 мая 2015 года диагноза в медицинском центре Samsung. В результате 186 человек, в том числе 25 медработников, были заражены, 181 из 186 случаев были связаны с внутрибольничной передачей вируса MERS. Эта вспышка ясно продемонстрировала эпидемический потенциал БВРС-коронавируса MERS, распространяющегося от человека к человеку.
К 20 августа 2020 года двадцать семь стран сообщили о случаях MERS, при этом большая часть стран находятся на Аравийском полуострове или около него, это Бахрейн, Иран, Иордания,
Кувейт, Ливан, Оман, Катар, Саудовская Аравия, ОАЭ и Йемен. Случаи, выявленные за пределами
Ближнего Востока, обычно происходят у путешественников, которые были заражены на Ближнем
Востоке, а затем вернулись в свои страны – это Алжир, Австрия, Китай, Египет, Франция, Германия,
Греция, Италия, Малайзия, Нидерланды, Филиппины, Республика Корея, Таиланд, Тунис, Турция,
Соединенное Королевство и Соединенные Штаты
(Esam I. Azhar, David S.C. Hui, Ziad A. Memish, Christian Drosten,