Файл: Коронавирусы.pdf

Alimuddin Zumla. The Middle East Respiratory Syndrome (MERS) // Infect Dis Clin N Am 33 (2019) 891–905. https://doi.org/10.1016/j.idc.2019.08.001)
К июлю 2020 года заболевание с ближневосточным респираторным синдромом было зарегистрировано почти у 2500 человек (в том числе 861 связанных с ним смертей, коэффициент летальности – 34,5%); большинство из этих случаев были зарегистрированы в Саудовской Аравии
(2102 случая, в том числе 780 связанных смертей, с коэффициентом летальности 37,1%).
Демографические и эпидемиологические характеристики зарегистрированных за период наблюдения с начала эпидемии случаев не показывают каких-либо существенных различий или изменений. Возрастная группа 50-59 лет продолжает подвергаться наибольшему риску первичного заражения. Возрастная группа 30-39 лет наиболее подвержена риску вторичного заражения. Количество смертей выше в возрастной группе 50-59 лет для первичных случаев, и в возрастной группе 70-79 лет – для вторичных случаев.
(World Health Organization 2019. Some rights reserved. This work is available under the Creative Commons Attribution-Non Commercial-Share Alike 3.0 IGO license (CC BY-NC-SA 3.0 IGO; https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/igo). Document no. WHO-EM/CSR/241/E)
А
Б
Случаи
заболевания
Год
2012
2013
2014
2015
2016
2017
2018
2019
ВСЕГО
Первичные
3 36 164 52 75 70 54 56
510

Вторичные
2 93 264 222 60 90 35 75
841
Смешанные
1 15 102 103 68 52 58
399
Неизвестные
28 219 78 11 5
1 10
352
ВСЕГО
5
158
662
454
249
233
142
199
2102
Рис. 15. БВРС-Коронавирус (MERS) А) Филогенетические родственные связи БВРС-коронавируса
(MERS), Б) взаимосвязи между возрастом, числом и тяжестью заболевания и таблица заболеваемости в Саудовской Аравии по годам
(World Health Organization 2019. Some rights reserved. This work is available under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-Share Alike 3.0 IGO license (CC BY-NC-SA 3.0 IGO; https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/igo). (Document no. WHO-EM/CSR/241/E)
Ситуация с заболеваемостью COVID-19
В ноябре-декабре 2019 года из Китая начали поступать сообщения о случаях респираторного заболевания неизвестной этиологии среди жителей города Ухань, административного центра провинции Хубэй. ВОЗ для обозначения агента, вызвавшего вспышку заболевания, сначала использовала термин «новый коронавирус 2019» (NCoV-19). Впоследствии было показано, что новый коронавирус является ближайшим родственником коронавируса SARS-
CoV-1 (гомология около 80%), вызвавшего эпидемию так называемой «атипичной пневмонии» в
2003 году. Научная группа Международного комитета по Таксономии Вирусов 11 февраля 2020 года присвоила вирусу новое имя – SARS-CoV-2
(Guo, Y.R., Cao, Q.D., Hong, Z.S., Tan, Y.Y., Chen, S.D., Jin, H.J., Tan, K.S.,
Wang, D.Y., Yan, Y., 2020. The origin, transmission and clinical therapies on coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak–an update on the status. Military Medical Research 7 (1), 1–10).
Соответственно, ВОЗ дала новое название болезни, вызванной коронавирусом SARS-CoV-2 – COVID-19 (CoronaVIrus Disease)
(World Health Organization. Coronavirus disease 2019
(COVID-19) Situation Report –64[EB/OL].[2020-03-24]. https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200324- sitrep-64-covid-19.pdf?sfvrsn=703b2c40_2)
. Молекулярно-генетический анализ выявил наибольшую гомологию генома вируса SARS-CoV-2 с двумя коронавирусами летучих мышей и частью генома коронавируса панголинов. Экстренные эпидемиологические расследования связали появление нового коронавируса с оптовым рынком Huanan Seafood и указали на его зоонозное происхождение
(ovel,
C.P.E.R.E., 2020. The epidemiological characteristics of an outbreak of 2019 novel coronavirus diseases (COVID-19) in China. Zhonghua liu xing bing xue za zhi= Zhonghua liuxingbingxue zazhi 41 (2), 145.; Perlman, 2020; European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC), 2020.
Outbreak of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2): Increased Transmission Beyond China—Fourth Update (PDF, 14th
February); World Health Organization (WHO), 2020a. WHO Director-General’s Opening Remarks at the Media Briefing on COVID-19—11 March
2020. (11 March)).
Заболевание стремительно распространилось по миру и уже через 8 месяцев регистрировалось в более чем 180 странах, число заболевших к 20 августа 2020 года превысило 22 миллиона человек, а умерших – 780 тысяч. При этом в России заболело более 930 тысяч человек и более 15 тысяч заболеваний окончились летальным исходом. Эволюционные генетические исследования показали, что попадание вируса от животных (возможно, летучих мышей) к людям, произошло в ноябре или в начале декабря 2019 года.
Рис. 16. Эпидемическая динамика ежедневного выявления новых больных COVID-19 в мире ()

WHO Coronavirus Disease (COVID-19) Dashboard Data last updated: 2020/10/11, 2:45pm CEST
Рис. 17. Летальность
(https://ru.wikipedia.org/wiki/COVID-19)

В конечном итоге тесты 79 сотрудников из 137 (57,6%) дали положительный результат на
СOVID-19. Постоянный контакт в одном и том же пространстве в течение длительного периода времени играл решающую роль.
Рекомендации по снижению риска заражения офисных сотрудников:

Ресторан. Празднование новогоднего вечера в китайском городе Гуанчжоу 24 января. Основной фактор риска – неправильно организованная вентиляция может стать решающим фактором риска, если контакт поддерживается в течение длительного периода времени. Кроме этого, социальная близость умножила риски заражения.
Один инфицированный COVID-19 (Пациент 0) присутствовал на праздновании. В течение нескольких дней после этого обеда еще девяти клиентам был поставлен диагноз COVID-19. Все зараженные, сидевшие за столами B и C, находились на расстоянии более метра от пациента 0, а некоторые – до 4,5 метров. Продолжительность времени обеда имела решающее значение.
Прием пищи семей, сидящих за столами В и С, в течение длительного периода времени совпадал по времени с приемом пищи Пациента 0, в то время как обедающие за столом D находились в ресторане в одно время с Пациентом 0 только в течение 18 минут. Ни один обедающий за столом
D не заразился.
Исследователи считают, что кондиционирование воздуха сыграло решающую роль. Это означало, что воздух непрерывно циркулировал между тремя столами, распространяя содержащие вирус микрокапельки, выделяемые Пациентом 0.
Рекомендации по снижению риска заражения пациентов ресторана:

Автобус. Китайские власти и исследователи из американских университетов проанализировали вспышку после буддийской церемонии, на которой присутствовали люди, путешествовавшие на двух автобусах в общей сложности 100 минут, по 50 минут в каждую сторону. Женщина с симптомами инфекционного заболевания (Пациент 0) ехала на одном из транспортных средств, где работал кондиционер, и воздух принудительно циркулировал по салону; 23 пассажира заразились.

В первом автобусе заразились 23 человека, во втором автобусе никто не заболел несмотря на то, что все они смешивались на церемонии.
Кондиционер был в режиме рециркуляции. Исследователи считают, что это было ключевым фактором заражения; пассажиры заразились независимо от расстояния до Пациента 0.
Ряд исследований, проведенных в Японии и других странах, показывает, что общественный транспорт не несет ответственности за множественные инфекции, пока пользователи соблюдают правила гигиены и защиты, особенно при использовании масок, предотвращающих/уменьшающих попадание вируса от зараженных людей в салон транспортного средства. Для профилактики инфекционных заболеваний предлагается ввести специальные меры защиты для водителей общественного транспорта, а также улучшить вентиляцию и повысить регулярность движения автобусов и поездов с целью уменьшения скопления людей.
Жизнеспособность коронавируса
Вода. В связи с пандемией коронавирусной инфекции возникает вопрос о времени сохранения жизнеспособности коронавируса SARS-CoV-2 в воде, как в питьевой, так и в воде открытых водоемов. Очевидно, что, если окружающая среда, в данном случае вода, окажется благоприятной для сохранения инфекционного агента, она будет представлять опасность для человека. Данные литературы подтверждают, что полная инактивации коронавируса SARS-CoV-2 в чистой воде без примесей происходит, как минимум, в течение нескольких дней. Недавно были проведены наблюдения в 39 странах мира за тем, как коронавирус SARS-CoV-2 ведет себя при попадании в воду, а также оценена опасность употребления неочищенной воды. Оказалось, что в реках и озерах он может находиться до 25 дней, а относительный риск заражения фекальными водами в конкретной стране зависит от окружающей среды. Загрязненные фекалиями реки, водные пути и водные системы в странах с высоким уровнем инфицирования могут обеспечить инфекционные дозы> 100 копий в 100 мл воды.

Рис. 18. Выживаемость вируса в воде и относительный риск, связанный с разливами сточных вод в реки для 39 стран; а) смоделированная живучесть, б) страны, в которых относительный риск соотнесен с относительным риском в виде линейной шкалы; серый цвет означает, что страна не включена в исследование.
Относительный риск заражения SARS-CoV-2 от систем сточных вод рассчитывается с использованием модифицированной версии уравнений 1 и 2 из работы
(Keller, V. D. J., Williams, R. J.,
Lofthouse, C. & Johnson, A. C. Worldwide estimation of river concentrations of any chemical originating from sewage-treatment plants using dilution factors. Environ. Toxicol. Chem. 33, 447–452 (2014). doi:10.1002/etc.2441)
Где:
-
V
ww, c
- ежедневный объем потребления воды для бытового потребления в стране с на душу населения,
-
DF
c
- коэффициент разбавления, загруженный из работы
(Keller, V. D. J., Williams, R. J., Lofthouse, C. & Johnson, A.
C. Worldwide estimation of river concentrations of any chemical originating from sewage-treatment plants using dilution factors. Environ.
Toxicol. Chem. 33, 447–452 (2014). doi:10.1002/etc.2441) дополнительной таблицы 1 и дополнительной таблицы 2, соответственно.
Нормализация Hc по медианным значениям DF по всей стране обеспечивает относительный риск инфекции, передаваемой через воду, из-за вирусной нагрузки в реке после разлива сточных вод, по стране с.
Данные по странам различались, рассчитанный максимальный срок сохранения вирусом инфекционной активности был продолжительным относительно других стран в озерах
Великобритании, Испании и Марокко
(Shutler J., Zaraska K., Holding T.M., Machnik M., Uppuluri K., Ashton I., Migdal
L.,
Dahiya
R.
Risk of
SARS-CoV-2 infection from contaminated water systems
// medRxiv 2020.06.17.20133504; doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.17.20133504.)
Есть сообщения, что коронавирус SARS-CoV-2 может сохранять свою инфекционную активность в пресных водоемах, в

морской воде морей и океанов. На скорость инактивации вируса влияют такие факторы как рН, температура и концентрации солей в воде
(
https://icvtormet.ru/prochee/zhivet-koronavirus-vode)
Поверхности. В обзоре
(Kampf G., Todt D., Pfaender S., Steinmann E. Persistence of coronaviruses on inanimate surfaces and their inactivation with biocidal agents //Journal of Hospital Infection, 104 (2020) 246-251)
собраны и приведены данные о проверке сохранения инфекционной активности коронавирусов на различных поверхностях.
Анализ независимо проведенных исследований показывает, что коронавирусы, в т.ч. человека, такие, как SARS, MERS могут сохраняться на таких поверхностях, как металл, стекло или пластик до
9 дней.
Таблица 3.
Сохранение инфекционной активности коронавирусов на различных типах поверхностей
(Kampf G.,
Todt D., Pfaender S., Steinmann E. Persistence of coronaviruses on inanimate surfaces and their inactivation with biocidal agents //Journal of
Hospital Infection, 104 (2020) 246-251)
Тип поверхности
Вирус (штамм)
Начальный титр вируса
Темпер атура
Срок сохранения инфекционно й активности
Литература
Сталь
MERS
(штамм
HCoV-EMC/2012)
10 5
20 0
С
48 ч van Doremalen N, Bushmaker T,
Munster VJ. Stability of Middle
East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) under different environmental conditions. Euro Surveill 2013;18.
30 0
С
8-24 ч
TGEV
10 6
4 0
С
> 28 суток
Casanova LM, Jeon S, Rutala WA,
Weber DJ, Sobsey MD. Effects of air temperature and relative humidity on coronavirus survival on surfaces. Appl Environ
Microbiol 2010;76:2712-7.
20 0
С
3-28 суток
40 0
С
4-96 ч
MHV
10 6
4 0
С
> 28 суток
20 0
С
4-28 суток
40 0
С
4-96 ч
229E
10 3
21 0
С
5 суток
Warnes SL, Little ZR, Keevil CW.
Human Coronavirus 229E Remains
Infectious on Common Touch
Surface Materials. mBio
2015;6:e01697-15.
Алюминий
229E и ОС43 5 х 10 3
21 0
С
2-8 ч
Sizun J, Yu MW, Talbot PJ. Survival of human coronaviruses 229E and
OC43 in suspension and after drying on surfaces: a possiblesource of hospital- acquired infections. J Hosp Infect
2000;46:55-60.
Металл
SARS (
штамм Р9
)
10 5
КТ
5 суток
Duan SM, Zhao XS, Wen RF,
Huang JJ, Pi GH, Zhang SX, et al.
Stability of SARS coronavirus in human specimens and
Шесть
SARS (
штамм Р9
)
10 5
КТ
4 суток

Бумага
SARS (
штамм Р9
)
10 5
КТ
4-5 суток environment and its sensitivity to heating and UV irradiation.
Biomed Environ Sci 2003;16:246-
55.
SARS
(
штамм
GUV6109
)
10 6
КТ
24 ч
Lai MY, Cheng PK, Lim WW.
Survival of severe acute respiratory syndrome coronavirus. Clin Infect Dis
2005;41:e67-71.
10 5
КТ
3 ч
10 4
КТ
< 5 мин
Стекло
SARS (
штамм Р9
)
10 5
КТ
4 суток
Duan SM, Zhao XS, Wen RF,
Huang JJ, Pi GH, Zhang SX, et al.
Stability of SARS coronavirus in human specimens and environment and its sensitivity to heating and UV irradiation.
Biomed Environ Sci 2003;16:246-
55.
229Е
10 3
21 0
С
5 суок
Warnes SL, Little ZR, Keevil CW.
Human Coronavirus 229E Remains
Infectious on Common Touch
Surface Materials. mBio
2015;6:e01697-15.
Пластик
SARS
(
штамм
HKU39849
)
10 5
22-25 0
С
< 5 суток
Chan KH, Peiris JS, Lam SY, Poon
LL, Yuen KY, Seto WH. The Effects of Temperature and Relative
Humidity on the Viability of the
SARS Coronavirus. Adv Virol
2011;734690.
MERS
(
штамм
HCoV-EMC/2012
)
10 5
20 0
С
2 суток van Doremalen N, Bushmaker T,
Munster VJ. Stability of Middle
East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) under different environmental conditions. Euro Surveill 2013;18.
30 0
С
8-24 ч
SARS (
штамм Р9
)
10 5
КТ
4 суток
Duan SM, Zhao XS, Wen RF,
Huang JJ, Pi GH, Zhang SX, et al.
Stability of SARS coronavirus in human specimens and environment and its sensitivity to heating and UV irradiation.
Biomed Environ Sci 2003;16:246-
55.
SARS
(
штамм
FFM1
)
10 7
КТ
6-9 суток
Rabenau HF, Cinatl J,
Morgenstern B, Bauer G, Preiser
W, Doerr HW. Stability and inactivation of SARS coronavirus.
Med Microbiol Immunol
2005;194:1-6.
229E
10 7
КТ
2-6 суток
ПВХ
229E
10 3
21 0
С
5 сут
Warnes SL, Little ZR, Keevil CW.
Human Coronavirus 229E Remains
Infectious on Common Touch
Surface Materials. mBio
2015;6:e01697- 15.
Силикон, резина
229E
10 3
21 0
С
5 сут
Латексные
229E и ОС43 5 х 10 3
21 0
С
< 8 ч
Sizun J, Yu MW, Talbot PJ. Survival of human coronaviruses 229E and