Файл: Утверждаю заместитель Министра здравоохранения Российской Федерации А. Н. Плутницкий временные методические рекомендации профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (covid19) 3 Версия 16 (18. 08. 2022)оглавление.pdf

176
Версия 16 (18.08.2022)
Приложение 3-1
Инструкция по проведению диагностики COVID-19
с применением методов
амплификации нуклеиновых кислот
Общие положения
В соответствии с приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации
№ 198н и Методическими рекомендациями MP3.1.0169-20
«
Лабораторная диагностика
COVID-19», утвержденными Главным санитарным врачом Российской Федерации
30.03.2020, диагностика новой коронавирусной инфекции проводится во всех лабораториях Российской Федерации вне зависимости от их организационно-правовой формы (далее – Лаборатория), имеющих санитарно-эпидемиологическое заключение о возможности проведения работ с возбудителями инфекционных заболеваний человека
III - IV патогенности и условия для исследований с применением МАНК.
Лабораторные исследлования проводятся в соответствии с приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации от 18 мая 2021 г. №464н «Об утверждении Правил проведения лабораторных исследований».
Для выявления возбудителя SARS-CoV-2 используются МАНК (без накопления возбудителя) с применением зарегистрированных в установленном порядке на территории
Российской Федерации тест-систем, в соответствии с инструкциями по их применению.
Этиологическая диагностика COVID-19 проводится с применением МАНК: полимеразной цепной реакции (ПЦР) и изотермальной амплификации (
LAMP)
Основным видом биоматериала для лабораторного исследования на РНК
SARS-CoV-2 является материал, полученный при заборе мазка из носоглотки (из двух носовых ходов) и ротоглотки. Мазки со слизистой оболочки носоглотки и ротоглотки собираются в одну пробирку для большей концентрации вируса. При признаках заболевания нижних дыхательных путей в случае получения отрицательного результата в мазках со слизистой носо- и ротоглотки дополнительно исследуются мокрота
(при наличии) или промывные воды бронхов, полученные при фибробронхоскопии
(бронхоальвеолярный лаваж),
(эндо)трахеальный, назофарингеальный аспират. У пациентов, находящихся на ИВЛ, с целью выявления
SARS-CoV-2 рекомендуется получение и исследование аспирата содержимого трахеи.
В качестве дополнительного материала для исследования могут использоваться биопсийный или аутопсийный материал легких, цельная кровь, сыворотка, фекалии.
Сбор, хранение и транспортировка диагностического материала
Забор диагностического материала, его упаковка, маркировка и транспортировка осуществляется в соответствии с требованиями и правилами по работе с материалами, потенциально инфицированными возбудителями II группы патогенности, их хранения и транспортировки согласно МУ 1.3.2569-09 «Организация работы лабораторий, использующих МАНК при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I – IV групп патогенности» и Методическим рекомендациям Роспотребнадзора MP 3.1.0169-20
«Лабораторная диагностика COVID-19».
Медицинский работник, выполняющий забор диагностического материала, его маркировку и упаковку, должен пройти инструктаж по санитарно-эпидемиологическим требованиям и правилам биологической безопасности при работе с пациентами, потенциально инфицированными микроорганизмами II группы патогенности.
Биологический материал (мазки из носоглотки, ротоглотки, фекалии) может быть отобран

177
Версия 16 (18.08.2022)
самостоятельно пациентом согласно инструкции. Медицинский работник должен быть обеспечен СИЗ
1
Мазок из носоглотки или ротоглотки (зева) берется стерильным тампоном, который после взятия материала помещается в стерильную пластиковую пробирку с транспортной средой (с учетом рекомендаций производителя применяемых наборов реагентов).
Для повышения концентрации вируса носоглоточные и орофарингеальные мазки должны быть помещены в одну пробирку. Температура при транспортировке должна быть +2°-+8
°C. Время хранения образцов до исследования не должно превышать 5 дней при +2°-+8 °C, может быть больше - при -20 °С или -70 °С.
Мокрота собирается в одноразовый стерильный пластиковый контейнер объемом
30-50 мл, герметично закрывающийся завинчивающейся пробкой. Диаметр горлышка контейнера должен быть не менее 30 мм. Необходимо убедиться, что собранный материал представляет собой мокроту (отделяемое нижних дыхательных путей). Транспортировка образцов может проводиться при температуре +2°-+8 °C. Время хранения образцов до исследования не должно превышать 48 часов при +2°-+8 °C при хранении в транспортной среде, содержащей противогрибковые и антибактериальные препараты, более - при -20 °C или -70 °C.
Эндотрахеальный аспират, аспират носоглотки или смыв из носа собирается в стерильный одноразовый контейнер. Транспортировка образцов может проводиться при температуре +2°-+8 °C. Время хранения образцов до исследования не должно превышать 48 ч при +2°-+8 °C, более – при -20 °C или -70 °C.
Бронхоальвеолярный лаваж собирается в стерильный одноразовый контейнер.
Транспортировка образцов может проводиться при температуре +2°-+8 °C. Время хранения образцов до исследования не должно превышать 48 ч при +2°-+8 °C, более – при -20 °C или -70 °C.
Ткани биопсии или аутопсии, включая легкие, помещаются в одноразовые контейнеры с физиологическим раствором, содержащим противогрибковые и антибактериальные препараты (собираются в стерильный одноразовый контейнер).
Транспортировка образцов может проводиться при температуре +2°-+8 °C. Время хранения образцов до исследования не должно превышать 24 ч при +2°-+8 °C, более – при -20 °C или -70 °C.
Для идентификации образцов контейнеры/пробирки маркируются в месте сбора с использованием самоклеящихся этикеток с информацией, обеспечивающей однозначную идентификацию образца и его соответствие направлению.
Транспортировка в лабораторию герметично закрытых контейнеров с образцами осуществляется в специальных контейнерах/биксах. Направления и другая документация на бумажных носителях передается в отдельном полиэтиленовом пакете.
При необходимости пересылки образцов в лабораторию другого медицинского учреждения выполняются требования к пересылке инфекционных материалов II группы патогенности
(СанПиН
3.3686-21.
«Санитарно-эпидемиологические требования по профилактике инфекционных болезней»).
1
Методические рекомендации MP 3.1.0229-21 "Рекомендации по организации противоэпидемических мероприятий в медицинских организациях, осуществляющих оказание медицинской помощи пациентам с новой коронавирусной инфекцией (COVID-19) (подозрением на заболевание) в стационарных условиях"

178
Версия 16 (18.08.2022)
Пробирки/контейнеры с образцами вместе с крышкой герметизируют различными пластификаторами (парафин, парафильм и др.); емкость маркируют. Образцы каждого пациента помещают в индивидуальный герметичный пакет с адсорбирующим материалом и дополнительно упаковывают в общий герметичный пакет.
Два или более образца одного пациента могут быть упакованы в один пластиковый пакет. Запрещается упаковывать образцы клинического материала от разных людей в одну упаковку.
Пакет с контейнерами помещают в герметично закрывающийся контейнер для транспортировки биологических материалов. Контейнер помещают в пенопластовый термоконтейнер с охлаждающими термоэлементами. Транспортный контейнер опечатывается и маркируется. В контейнер желательно поместить одноразовый индикатор, контролирующий соблюдение температуры от +2° до +8 °С.
Сопроводительные документы помещаются в индивидуальную упаковку отдельно от биологического материала и прочно прикрепляются снаружи контейнера.
Направление на исследование
Направление на лабораторное исследование оформляется в электронном виде (через систему удаленной электронной регистрации или в виде электронного заказа в программе
МИС врачом-клиницистом) или на бумажном носителе.
Направление на лабораторное исследование должно содержать: персональные данные пациента, обеспечивающие его однозначную идентификацию; наименование направившего биоматериал отделения (организации); предварительный диагноз заболевания: «пневмония» или «ОРВИ» или «обследование контактировавших лиц на SARS-CoV-2»; указание вида диагностического материала; дату и время назначения лабораторного исследования; дату и время взятия материала; фамилию, имя, отчество (при наличии) и должности врача либо другого уполномоченного представителя, назначившего лабораторное исследование; фамилию, имя, отчество (при наличии) медицинского работника, осуществившего забор биоматериала.
При направлении диагностических материалов для исследования в лабораторию другой медицинской организации, помимо сведений, перечисленных выше, должно быть указано наименование медицинской организации, в которую направляется диагностический материал.
В направлениях образцов пациентов с респираторными симптомами, прибывших из стран с зарегистрированными случаями COVID-19 или относящихся к группам риска, должно быть отмечено «Сito». Эти образцы должны направляться в лабораторию и исследоваться в приоритетном порядке.
Передача образцов диагностических материалов от пациентов с подозрением на COVID-19 проводится с предоставлением направлений и оформлением Акта приема-передачи, в котором должны содержаться:

179
Версия 16 (18.08.2022)
наименование медицинского учреждения/отдела/подразделения, направившего на исследование образцы; наименование медицинского учреждения/отдела/подразделения, принявшего на исследование образцы; дату передачи образцов; фамилию, имя, отчество и подпись сотрудника, передавшего образцы; фамилию имя, отчество и подпись сотрудника, принявшего образцы; перечень передаваемых образцов (с обозначением образцов, направленных на исследование «Сito») и их количество.
Акт оформляется в двух экземплярах: один - для направившей организации, другой - для принявшей образцы организации.
Сроки выполнения исследования
Срок выполнения лабораторного исследования на COVID-19 не должен превышать
24 часов с момента поступления биологического материала в лабораторию до получения его результата лицом, в отношении которого проведено соответствующее исследование.
При назначении исследования «Сito» результат должен быть предоставлен в течение нескольких часов, в зависимости от применяемых наборов реагентов.

180
Версия 16 (18.08.2022)
Лабораторные этапы диагностики
На этапе приема, сортировки и регистрации материала лаборатория должна проводить выбраковку образцов, для которых информация в направлении не совпадает с данными на этикетке или в Акте передачи, нарушены сроки и правила транспортировки, нарушена герметичность контейнеров. Лаборатория обязана сообщить в медицинское учреждение/отделение или направившему образцы врачу о выбраковке образцов и ее причине.
Для проведения МАНК лаборатории применяют зарегистрированные в Российской
Федерации как изделия медицинского назначения тест-системы/реагенты. Специалисты лаборатории должны владеть МАНК.
При получении положительного результата на COVID-2019 необходимо незамедлительно информировать территориальные органы Роспотребнадзора в субъектах
Российской Федерации и направлять биологический материал в федеральные бюджетные учреждения здравоохранения – центры гигиены и эпидемиологии в субъектах Российской
Федерации.
Дезинфекция, обращение с отходами
В помещениях лаборатории проводятся дезинфекционные мероприятии с учетом зонирования
1
. В помещениях рабочей зоны 1 (прием и разбор материала, его маркировка, первичная обработка и обеззараживание) ежедневно проводят текущую уборку с применением дезинфицирующих средств. В рабочих зонах 2
(выделение и очистка РНК патогена из образцов, подготовленных в рабочей зоне 1),
3 (приготовление реакционных смесей, проведение реакции обратной транскрипции, амплификации нуклеиновых кислот и учет результатов гибридизационно- флуоресцентным методом детекции) или 2 - 3 рекомендуется ежедневно проводить: обработку помещений ультрафиолетовым излучением перед началом и после окончания работ; обработку ультрафиолетовым излучением соответствующих боксов микробиологической безопасности и ПЦР-боксов после окончания каждого этапа исследований (выделения нуклеиновых кислот и проведения амплификации); обработку рабочих поверхностей боксов микробиологической безопасности и ПЦР-боксов после окончания работ хлорактивными дезинфицирующими средствами
(хлорамин, дезинфицирующие средства на основе натриевой соли, дихлоризоциануровой кислоты, дезинфицирующие средства на основе трихлоризоциануровой кислоты (ДП-2Т)) с удалением остатков дезинфицирующих средств с поверхностей боксов микробиологической безопасности и ПЦР-боксов с последующей обработкой ультрафиолетовым излучением в течение 30 мин перед началом работ; текущую влажную уборку полов после окончания работ разрешенными к применению дезинфицирующими средствами.
1
МР 3.1.0229-21. Рекомендации по организации противоэпидемических мероприятий в медицинских организациях, осуществляющих оказание медицинской помощи пациентам с новой коронавирусной инфекцией (COVID-19).