ВУЗ: Не указан

Категория: Не указан

Дисциплина: Не указана

Добавлен: 05.12.2023

Просмотров: 133

Скачиваний: 1

ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.

Неадекватные образцы включают мазок из носоглотки без сопровождающего образца из нижних дыхательных путей, образец, с которым неправильно обращались, который был признан низкокачественным лабораторией, проводящей тестирование, или образец, взятый слишком поздно в ходе болезни.
3
Неокончательные тесты могут включать:

положительный результат скрининга на одной мишени ПЦР-РВ без последующего подтверждения;

подтверждение с помощью одного образца сыворотки, взятой в фазе выздоровления, в идеале не позднее чем через 14 дней после скринингового исследования (ELISA, или ИФА) и пробы на нейтрализацию, в отсутствие молекулярного подтверждения на респираторных образцах.

(
https://www.who.int/csr/disease/coronavirus_infections/mers_cov_interim_case_definition_jul2015_
ru.pdf?ua=1
)
ВОЗ предложено (
Глобальный эпиднадзор за случаями инфекции человека, вызванной новым
коронавирусом (2019-nCoV) Временные рекомендации 31 января 2020
) следующее стандартное определение случаев COVID-19:
Подозрительный на инфекцию, вызванную 2019-nCoV, случай
А. Наличие проявлений тяжелой острой респираторной инфекции (лихорадка, кашель, при этом требуется госпитализация) И отсутствие других этиологических факторов, которыми в полной мере объяснялась бы клиническая картина, А ТАКЖЕ анамнез поездок или пребывания в КНР в предшествующие 14 дней до появления симптомов,
ИЛИ
B. Наличие любых тяжелых проявлений патологии дыхательной системы И по меньшей мере одного из следующих фактов эпидемиологического анамнеза в предшествующие 14 дней до появления симптомов: a) наличие контактов с лицами, у которых установлен вероятный или подтвержденный случай инфекции
2019-nCoV; или b) имеется анамнез работы или посещения лечебного учреждения, где находились пациенты с подтвержденными или вероятными случаями инфекции 2019-nCoV.
Вероятный случай инфекции
Вероятный случай инфекции: подозрительный случай, при котором результаты тестирования на инфекцию, вызванную 2019-nCoV, сомнительны (под сомнительным подразумевается результат,
сформулированный так в лабораторном заключении), либо имеются положительные результаты теста на определение всех видов семейства коронавирусов в отсутствие лабораторного подтверждения наличия других респираторных патогенов.
Подтвержденный случай инфекции
Наличие лабораторного подтверждения инфекции, вызванной 2019-nCoV, независимо от клинических проявлений и симптомов.
(
https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/330857/WHO-2019-nCoV-SurveillanceGuidance-2020.3- rus.pdf
)
После появления в широком доступе диагностических тест-систем диагноз подтверждается лабораторно.
Клинические симптомы ТОРС (SARS -атипичной пневмонии). У пациентов наблюдали трехфазный характер заболевания (Peiris и др., 2003а). Первоначально чаще всего у пациентов регистрировали лихорадку, сухой кашель, ангину и головные боли, затруднение дыхания регистрировали в более поздние сроки (7-14 сутки болезни). Во время второй фазы болезни возникает одышка и гипоксия на фоне продолжающейся лихорадки, часто сопровождается поносом. У части пациентов развивается острый респираторный дистресс синдром (3-я фаза), часто требующий подключения больного к аппарату ИВЛ примерно к 3-й неделе заболевания.
Летальный исход заболевания может быть зарегистрирован уже на четвертый день, но есть случаи регистрации смерти через 108 дней после начала заболевания. Выделение вируса из дыхательных путей, как правило, достигает максимума на 10-е сутки. Вирус практически всегда

также находили в фекалиях. Антитела IgG выявлялись к 10-15-м суткам, и после их появления вирусемия снижалась. Тяжесть заболевания коррелировала с увеличением возраста, при этом смертность достигала 50% для пациентов старше 60 лет.
При вскрытии пациентов наблюдалось диффузное повреждение альвеол. В легких у пациентов, которые умерли на ранних стадиях заболевания, регистрировались образовании гиалиновых мембран, отеки, фибриновый экссудат, тромбы мелких сосудов, потеря и отслоение пневмоцитов и смешанный клеточный инфильтрат, состоящий из лимфоцитов, макрофагов и полиморфноядерных лейкоцитов. На более поздних стадиях заболевания гистологическая картина проявлялась в виде пневмонита, пневмоцитоз, плоскоклеточная метаплазия и бронхиолит. Связь прогрессирования заболевания с уменьшением вирусной нагрузки и существенное повышение уровня цитокинов свидетельствуют о том, что тяжелые повреждения легких носили в основном иммунопатологический характер.
(Weiss S.R., Leibowitz J.L. Coronavirus Pathogenesis//
Advances in Virus Research, 2011, Volume 81, р. 85-164.)
Клинические симптомы БВРС не являются специфичными и похожи на другие инфекции дыхательных путей. Клиническая картина заболевания включает в себя широкий спектр проявлений: от бессимптомной инфекции до легкого, умеренного и тяжелого заболевания, часто осложненного тяжелой пневмонией, острым респираторным дистресс-синдромом (ОРДС), септическим шоком и полиорганной недостаточностью. Незначительное число случаев могут проходить с низкой температурой, ознобом, насморком, сухим кашлем, болью в горле и миалгией. У некоторых пациентов проявляются желудочно-кишечные симптомы, такие как тошнота, рвота и диарея. Лихорадка может отсутствовать в 15% случаев госпитализации.
Лабораторные исследования выявляют цитопению и повышенный уровень трансаминазы. До половины случаев могут иметь острое повреждение почек, а у трети – серьезные поражения желудочно-кишечного тракта. В тяжелых случаях болезнь может вызвать дыхательную недостаточность, которая требует искусственной вентиляции легких и поддержки в отделении интенсивной терапии. Существует реальная угроза быстрого (до 2 дней) развития ОРДС и мультиорганной недостаточности. Коронавирус MERS вызывает более тяжелые заболевания у пожилых людей, людей с ослабленной иммунной системой и у людей с хроническими заболеваниями почек, легких, а также у онкологических больных и больных диабетом
(Esam I. Azhar,
David S.C. Hui, Ziad A. Memish, Christian Drosten, Alimuddin Zumla. The Middle East Respiratory Syndrome (MERS) Infect Dis Clin N Am 33
(2019) 891–905 https://doi.org/10.1016/j.idc.2019.08.001)
Клинические особенности COVID-19 варьируют от бессимптомного состояния до острого респираторного дистресс-синдрома и полиорганной дисфункции. Теоретически рассчитанная
50%-ная инфицирующая доза может составлять примерно 50 вирионов. Общие клинические признаки включают лихорадку – повышение температуры (не во всех случаях), кашель, усталость, одышку, боль в горле, головную боль, рвоту, диарею. Конъюнктивит также был описан. Таким образом, они симптоматически неотличимы от других респираторных инфекций. У некоторых пациентов к концу первой недели заболевание может прогрессировать до пневмонии, дыхательной недостаточности и смерти. Это прогрессирование связано с чрезмерным увеличением количества воспалительных цитокинов, включая IL2, IL7, IL10, GCSF, IP10, MCP1,
MIP1A и TNFα. Среднее время от появления симптомов до одышки составляло 5 дней, госпитализация – 7 дней, острый респираторный дистресс-синдром (ОРДС) – 8 дней. Потребность в интенсивной терапии была отмечена у 25-30% больных в опубликованных статьях.
Наблюдаемые серьезные осложнения включали острое повреждение легких, ОРДС, шок и острое повреждение почек. Восстановление начиналось на 2-й или 3-й неделе после начала заболевания.
Средняя продолжительность пребывания в стационаре у тех, кто выздоровел, составила 10 дней.


Неблагоприятные исходы и смерть чаще встречаются у пожилых людей и лиц с сопутствующими заболеваниями (50-75% смертельных случаев). Летальность у госпитализированных взрослых пациентов колебалась от 4 до 11%. По оценкам, общий коэффициент смертности от 2 до 3%
(
Singhal
T. A Review of Coronavirus Disease-2019 (COVID-19). Indian J Pediatr. 2020;87(4):281‐286. doi:10.1007/s12098-020-03263-6)
Клинические проявления коронавирусных инфекций, вызываемых вирусами SARS, MERS и SARS-
CoV-2
Rabaan AA, Al-Ahmed SH, Haque S, et al. SARS-CoV-2, SARS-CoV, and MERS-COV: A comparative overview. Infez Med. 2020;28(2):174-184
SARS
MERS
SARS-CoV-2
Клиническая
эпидемиология:
-
Количество заболевших
8 098 2 499 71 704 885
-
Количество погибших
744 861 1 605 017
-
Летальность
10%
35%
6%
-
Инкубационный период
2-7 сут
5-6 сут
7-14 сут
Клетки органов, наиболее восприимчивых к заражению
Дыхательных путей; почек; печени
Дыхательных путей; кишечного тракта; мочеполовых путей; печени, почек, нейроны; моноциты;
T- лимфоциты, а также гистиоцитарные клеточные линии
Дыхательных путей; почек; печени, пищевода, мочевого пузыря, подвздошной кишки, сердца, ЦНС
Клиническая картина
заболевания
Средний возраст
39.9 (1-91) лет
53 (36-
66) года
47 (все возраста) лет
Соотношение мужчины:женщины
1.0 : 1.25 2.03 : 1.0 1.39 : 1.0
Лихорадка
99 - 100%
77 + 6%
88,7%
Усталость
31,2%
-
29,4%
Кашель
25 - 75%
70 + 5%
67,7%
Отхаркивание мокроты не зарегистрировано нет данных
13.3%
Головная боль
49.3
– 60,9% нет данных
14.8%
Затруднение дыхания, одышка
40-42%
нет данных
45.6%

Ангина
12.5%
39 + 11%
13,9%
Диарея
20 - 25%
10
– 20%
6.1%
Тошнота и / или рвота
19.4
– 19.6% нет данных
5.0%
Головокружение
4.2
– 42.8% нет данных
3.7%
Головная боль
35.4
– 55.8% нет данных
8.0 %
Животные модели коронавирусов
Коронавирусы могут реплицироваться во многих видах животных, включая свиней, крупный рогатый скот, лошадей, верблюдов, кошек, собак, грызунов, птиц, летучих мышей, кроликов, хорьков, норок, змей и других диких животных. Для многих животных заболевания являются субклиническими. Если вопрос о природном резервуаре опасных для человека вирусов
SARS и MERS в настоящее время считается решенным, то происхождение нового коронавируса
SARS-CoV-2 активно дискутируется. Одним из методов определения родственных связей является исследование относительного смещения синонимических кодонов (RSCU - relative synonymous codon usage). Метод был применен для определения потенциального природного хозяина нового коронавируса SARS-CoV-2.


Рис. 22. Сравнение относительного использования синонимичных кодонов (RSCU) между 2019- нКоВ и его предполагаемым резервуаром (-ами) диких животных. A. Тепловая карта, полученная в результате кластерного анализа RSCU между вирусами 2019-nCoV, bat-SL-CoVZC45, Bungarus
multicinctus, Naja atra, Marmota, Erinaceus europaeus, manis javanica, Rhinolophus sinicus, Gallus
gallus, Homo sapiens. Б. Сравнение квадрата евклидова расстояния (рассчитывался на основе RSCU) между 2019 нКоВ и различными видами животных
(Wei Ji, Wei Wang, Xiaofang Zhao et al. Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross-species transmission from snake to human// Journal of
Medical Virology, 2020, 92(4) DOI: 10.1002/jmv.25682)
Другое исследование показало, что панголины могут быть потенциальными промежуточными хозяевами
(Lam T.T.-Y., Shum M.H.-H., Zhu H.-C. 2020. Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in
Malayan pangolins in southern China. bioRxiv preprint 2020:epub).
Тяжелый острый респираторный синдром (ТОРС, SARS, атипичная пневмония). Самые ранние случаи атипичной пневмонии в провинции Гуандонг (Китай) были зарегистрированы у работников, продающих на рынках диких животных. Последующие исследования диких животных, взятых в исследование с этих рынков, показало наличие коронавируса SARS у пальмовых циветт (Paguma larvata) и енотовидных собак (Nyctereutes procyonoides). Более продолжительное время выделения коронавирусов было обнаружено у пальмовых циветт. Кроме этого, среди поставщиков продуктов питания в ресторанах, в которых подают мясо циветт, было
зарегистрировано больше случаев заболевания. Сравнение последовательностей геномов штаммов коронавируса SARS, выделенных из циветт, с последовательностями штаммов, выделенных от заболевших, подтвердило передачу вируса от этих животных к людям (Hu et al.,
2003; Song et al., 2005; Yeh et al., 2004). Последующее открытие SARS-подобных коронавирусов у летучих мышей Rhinolophus sinicus с приблизительно 90% идентичностью последовательностям выделенного от человека вируса позволяет с большой вероятностью предположить, что этот или родственный ему вид летучих мышей, вероятно, и является источником ТОРС-коронавируса (Lau et al., 2005; Li et al., 2005b).
Сравнение последовательностей геномов высокопатогенных изолятов вируса SARS, выделенных во время эпидемии атипичной пневмонии 2002-2003 гг. (например, TOR-2 или
Urbana), с последовательностями геномов коронавирусов, выделенных от людей с более легким течением заболевания 2003 года, а также выделенных от циветт и енотовидных собак в начале эпидемии и выделенных от летучих мышей, показали, что различия составляют всего одну или две аминокислоты (N479 и T487) в S белке, за исключением известной делеции в нем же. Эти изменения, вероятно, были ответственны за адаптацию вируса SARS к человеку. Большинство вирусов, выделенных из пальмовых циветт, кодируют K479, и рецептор-связывающий домен вируса становится совместим с рецептором клеток пальмовой циветты ACE2. Мутация N479 приводит к совместимости рецептор-связывающий домен вируса с рецептором клеток человека.
Вирусы, изолированые от более легких случаев SARS-коронавирусной инфекции у людей в 2003-
2004 годах, кодируют S487, и одинаково эффективно связываются с рецепторами клеток пальмовых циветт и человека. Эти изоляты менее эффективно связываются с ACE-2 человека, чем содержащие мутацию T487, связанную с более патогенными изолятами человека.
Для выделения коронавирусов используют культуры клеток Vero, Vero E6, NCI-H292, FRhk –
4, 4647, 293, Л-68. При культивировании штамма Франкфурт 1 вируса SARS (любезно предоставленный Dr. H.W. Doerr, Институт медицинской вирусологии, Франкфурт-на-Майне,
Германия) отмечено, что характер поражения монослоя различался в зависимости от линии клеток. В культурах клеток Vero и 4647 при множественности заражения 1:10 на 2-е и 3-и сутки после заражения, соответственно, происходило округление клеток и сползание монослоя. При культивировании вируса на клетках 293 и Л-68 изменения монослоя выявлялись на 3-и сутки и проявлялись в виде разрушения монослоя – наблюдался локальный лизис клеток
(Агафонов А.П.,
Гуськов А.А., Терновой В.А., Рябчикова Е.И., Дурыманов А.Г., Виноградов И.В., Максимов Н.Л., Игнатьев Г.М., Нечаева Е.А., Нетесов С.В.
Первичная характеризация ТОРС-коронавируса штамм Франкфурт 1// Докл. Акад. Наук, 2004.- том 394.- №4.- Стр. 58-60.).
Ряд животных моделей был разработан во время и после вспышки атипичной пневмонии.
К ним относятся модели нечеловеческих приматов: макаки M. fascicularis и M. mulatta, африканские зеленые обезьяны (Cercopithecus atheiops или Chlorocebus sabeus), мартышки
(Callithrix jacchus). Хотя в дыхательных путях всех этих видов после заражения обнаруживают репликацию ТОРС-коронавируса, у них развивается относительно легкая болезнь. ТОРС- коронавирус также способен заражать кошек (Felis domesticus) и хорьков (Mustela furo) (Martina et al., 2003), но инфекция не приводит к тяжелому заболеванию.
ТОРС-коронавирус размножается в течение короткого периода времени в дыхательных путях молодых мышей BALB/с, достигая значительных титров в легких, но не вызывает значимых патологических изменений и не приводит к заболеванию. Аналогично болезни у людей, чем больше возраст инфицированных коронавирусом мышей линии BALB/с, тем более тяжелое заболевание у них развивается: более высокие титры вируса в легких, более явные клинические признаки заболевания и четкие гистологические изменения интерстициального пневмонита с

альвеолярным повреждением – аналогичные наблюдаемым у человека при SARS (Roberts et al.,
2005a). В отличие от мышей BALB/c 4–6-недельного возраста, мыши возрастом 12–14 месяцев имели повышенные уровни IFN-a, IFN-γ и TNF-a на ранней стадии инфекции, что свидетельствует о высоком уровне провоспалительных цитокинов и способствуют более тяжелой болезни.
Коронавирус SARS инфицирует мышей линий C57BL6 (B6), 129SvEv.
Заражение сирийских хомячков коронавирусом
SARS приводило к острому интерстициальному пневмониту и поражению печени (что обычно не наблюдается при коронавирусной инфекции, вызванной вирусом SARS у человека) без клинических проявлений, вирус полностью исчезал из организма хомячков к 14 дню (Roberts et al., 2005b).
Известно, что коронавирусы содержат белок эстераза-гемагглютинин, придающий вирусу свойство агглютинировать эритроциты различных видов животных. Штамм Франкфурт 1 вируса
SARS-CoV-1 агглютинировал эритроциты человека, крысы, морской свинки, слабо агглютинировал эритроциты мыши (линия BALB/c) и не агглютинировал эритроциты обезьяны (Macaca mulatta), петуха, гуся, барана
(Агафонов А.П., Гуськов А.А., Терновой В.А., Рябчикова Е.И., Дурыманов А.Г., Виноградов И.В., Максимов
Н.Л., Игнатьев Г.М., Нечаева Е.А., Нетесов С.В. Первичная характеризация ТОРС-коронавируса штамм Франкфурт 1// Докл. Акад. Наук,
2004.- том 394.- №4.- Стр. 58-60.).
1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   ...   14