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Manuel d’étude et de gestion des oiseaux et de leurs habitats en zones côtières, 2012 

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Les  sédiments  estuariens  proviennent  de  trois  origines  :  les  apports 

marins  de  la  plate-forme  continentale,  les  apports  fluviatiles  en  provenance 
du bassin-versant, et les berges mêmes de l’estuaire. 
 
 

Les apports fluviaux et marins sont transportés et déposés différem-

ment  par  les  processus  estuariens.  Les  apports  marins  sont  plus  sableux, 
souvent riches en débris calcaires biogènes, et cheminent essentiellement sur 
le  fond  du  chenal  vers  l’amont,  par  roulage  et  saltation,  n’atteignant  les 
berges qu’à la faveur des remaniements liés aux fortes crues (construction de 
levées  naturelles).  Les  apports  de  sédiments  fluviaux,  au  contraire,  ont 
presque  partout  connu  des  transformations  importantes  au  cours  du 

XX

e

 siècle  (variation  de  la  nature  et  du  volume  des  apports  sédimentaires, 

liée aux changements de l’usage du sol dans les bassins-versants, ou réduc-
tion des débits de crue en liaison avec la construction de barrages). La frac-
tion  fine  vaseuse  des  sédiments  estuariens  a  une  origine  ubiquiste  (Pinot, 
1998). 
 
 

La  sédimentation  estuarienne  se  fait  au  niveau  du  bouchon  vaseux 

dans  le  fond  des  chenaux,  mais  aussi  sur  les  parties  hautes  des  berges  par 
décantation des particules fines. La décantation a lieu essentiellement durant 
les étales de pleine mer, vers l’amont en période d’étiage, vers l’aval lors des 
crues (Guilcher, 1954). Les relations entre la morphologie, la dynamique et 
les  faciès  sédimentaires  d’un  estuaire  s’inscrivent  dans  système  très  large, 
allant de la partie amont du cours d’eau jusqu’au bord de la plate-forme con-
tinentale (Allen & Klingebiel, 1974). 
 
 

On évoque fréquemment les notions de marée de salinité et de marée 

dynamique, ces deux marées remontant parfois très loin dans les terres, mais 
leur limite amont ne coïncide généralement pas.  
 
 

Le chenal est la forme essentielle de l’estuaire. Il prend la suite du lit 

mineur  à  l’amont,  et  part  du  calibre  de  ce  lit.  L’estuaire  proprement  dit 
commence  là  où  l’influence  de  la  marée  devient  assez  grande  pour  que  la 
section du chenal augmente (Pinot, 1998). La rencontre des systèmes fluvial 
et marin est dictée par le rapport de force entre le débit du fleuve et le vo-
lume oscillant qui y pénètre à chaque marée. 
 
 

Les  formes  héritées  de  la  sédimentation  estuarienne  sont  de  deux 

ordres :  
- d’une part, à l’amont de l’estuaire, le chenal est bordé de levées constituées 
de  sédiments  assez  grossiers  apportés  par  les  fleuves  lors  des  fortes  crues, 


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tandis  que  sur  la  plaine  inondable  se  décantent  les  matériaux  fins.  Vers 
l’aval, l’importance relative du fleuve diminuant, les levées deviennent plus 
étendues sur les rives convexes du chenal. Près de l’embouchure, les zones 
marécageuses  en  cours  de  colmatage  par  des  vases  d’origine  marine  sont 
colonisées par la végétation halophile.  
-  d’autre  part,  les  fleuves  au  régime  contrasté  présentent  des  îles  submer-
sibles  lors  des  fortes  crues.  Ces  îles  sont  constituées  essentiellement  de 
sable,  d’origine  fluviale  à  l’amont  et  marine  à  l’aval,  avec  une  fraction  va-
seuse plus ou moins importante selon les lieux. 
 
 

L’évolution des estuaires tend vers le colmatage progressif des zones 

exondables.  À  l’amont,  l’estuaire  prend  peu  à  peu  des  caractères  de  vallée 
fluviale,  le  chenal  se  réduit,  les  levées  latérales  prennent  de  l’ampleur  à 
chaque  forte  crue,  les  prairies  inondables  sont  exhaussées  par  alluvionne-
ment. On passe donc du remblaiement latéral et marginal de l’estuaire à un 
remblaiement  quasi  généralisé  de  part  et  d’autre  du  chenal.  À  l’aval,  la  ré-
duction du volume d’eau oscillant permet à des bancs sableux de s’aligner en 
travers de l’estuaire. Cet étranglement se produit lorsqu’il y a abondance de 
matériaux grossiers apportés soit par le fleuve, soit par la dérive littorale. 
 
 

La  morphologie  complexe  et  variable  des  estuaires  traduit  la  ten-

dance inéluctable au remblaiement, modulée dans le temps par les variations 
du niveau marin, les fluctuations climatiques, les changements de débit et de 
régime  du  fleuve.  La  rencontre  entre  les  deux  milieux  eaux  douces/eaux 
salées  est  une  zone  turbide  oscillant  entre  l’amont  et  l’aval  en  fonction  du 
rapport entre le débit fluvial et le volume oscillant de la marée. La circula-
tion résiduelle estuarienne se traduit par un double gradient granulométrique, 
avec passage des sédiments grossiers aux sédiments fins à la fois transversa-
lement  depuis  le  chenal  jusqu’aux  parties  hautes  des  berges  et  longitudina-
lement d’aval en amont.  
 

Contexte botanique  

Den  Hartog  (1959)  a  plus  spécifiquement  étudié  les  estuaires  des 

Pays-Bas,  en  particulier  le  devenir  de  la  végétation  algale  de  leurs  berges 
lorsque ceux-là sont barrés, modifiant par là-même le régime des marées en 
deçà  du  barrage  alors  que  le  régime  antérieur  était  le  principe  même  de 
l’organisation  altitudinale  de  la  végétation  des  berges.  Quoique  cet  auteur 
considère en première analyse que les limites entre les ceintures de végéta-
tion sont à déterminants surtout biologiques, il ne dénie pas qu’il existe une 
relation  serrée  entre  la  situation  de  ces  ceintures  et  les  mouvements  de  la 
marée.  Cependant,  les  Balanes,  Littorines  et  Laminaires,  dans  les  parties 


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rendues saumâtres et même douces des estuaires, ne peuvent plus servir de 
marques de reconnaissance des différentes ceintures. Dans ces estuaires pro-
tégés,  où  le  facteur  d’exposition  aux  vagues  est  secondaire,  Den  Hartog 
(1959)  considère  que  les  niveaux  hydrographiques  dans  l’estuaire  corres-
pondent approximativement, dans leurs effets, aux niveaux marégraphiques 
à l’extérieur des barrages, avec cependant un marnage plus réduit. 

 
Comme  pour  les  sédiments,  un  double  gradient  floristique, 

transversal  et  longitudinal,  s’observe  notamment  dans  les  parties  aval  et 
médiane  des  estuaires  (Beeftink,  1965 ;  Wolff,  1973).  Le  premier  gradient, 
transversal,  est  classiquement  un  gradient  d’inondation  des  berges  du 
fleuve ;  le  second,  longitudinal,  varie  en  fonction  de  la  circulation  des 
masses  d’eaux  douce  et  salée,  de  leur  mélange  et  de  leur  stratification.  Ce 
gradient  longitudinal  de  salinité  agit  jusqu’à  la  limite  de  remontée  de  la 
marée  de  salinité.  Plus  en  amont,  où  persiste  la  marée  dynamique,  seul  le 
gradient  transversal  d’inondation  influence  la  répartition  des  populations 
végétales. 

 
D’une manière schématique, la 

figure

 6 résume les modalités de pas-

sage  de  la  végétation  halophile  du  secteur  aval,  marin,  d’un  estuaire  à  la 
végétation de caractère continental du fleuve ou de la rivière qui le précède 
en  amont.  Il  existe  d’un  secteur  intermédiaire,  mixohalin  ou  saumâtre,  qui 
assure la transition entre les deux précédents. 


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Figure

 6 : modalités de passage entre végétations halophile et continentale en milieu 

estuarien 

La  principale  caractéristique  écologique  de  cette  interface  eaux 

douces–eaux  salées  découle  du  positionnement  supralittoral  des  espaces 
situés un peu au-dessus des hautes mers moyennes, niveau analogue à celui 
des terrains relevant du lit majeur dans les hydrosystèmes continentaux. Les 
limites  amont  des  secteurs  marin  et  intermédiaire,  reconnues  à  partir  des 
gradients de salinité et de submersion, ne coïncident pas avec la répartition 
des  différents  groupes  écologiques  caractéristiques  des  berges.  Le  phéno-
mène le plus important est la « submergence » de la végétation halophile et 
halo-tolérante vers l’amont, cette dernière précédant la végétation à caractère 
plus continental des berges. À l’inverse, la végétation continentale va avoir 
tendance  à  se  développer  à  des  niveaux  de  plus  en  plus  élevés  vers  l’aval 


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(phénomène  d’« émergence »),  pour  se  cantonner  finalement  au  voisinage 
des  sources  ou  des  zones  de  décharge  des  nappes  d’eau  douce,  le  long  des 
rives  où,  pour  les  mêmes  raisons,  se  cantonne  la  végétation  « saumâtre » 
dans le secteur aval de l’estuaire (

figure

 6, coupes A et B). 

 
En milieu estuarien, il n’existe pas de relais brutal intersecteur, mais 

plutôt  une  disposition  emboîtée  des  différentes  végétations,  ouverte  vers 
l’aval.  Ainsi,  dans  le  domaine  supralittoral  de  l’estuaire,  on  observe  non 
seulement  un  gradient  floristique  longitudinal,  mais  aussi,  au  niveau  des 
zones de transition entre secteurs, un étagement hétérogène qui s’écarte de la 
zonation fondamentale propre à chaque secteur.  

 
Par ailleurs, vers la mer, l’espace situé en dessous des pleines mers 

moyennes est de moins en moins colonisable par une végétation continue et 
il  présente  les  caractéristiques  d’un  habitat  de  « haute-slikke ».  À  niveau 
équivalent vers l’amont, l’habitat analogue est le domaine d’une végétation 
de  grandes  herbes  (roselières  et  scirpaies)  dont  l’apparition  signale  le  pas-
sage effectif du secteur intermédiaire au secteur amont de l’estuaire.  

Marais maritimes et lagunes côtières 

Organisation générale des estrans vaseux  

Les marais maritimes ou marais salés se développent dans les fonds 

de  baie  et  les  échancrures  du  rivage,  abritées  des  houles,  en  arrière  des 
flèches  sableuses  dans  les  lagunes  côtières  et  dans  les  estuaires,  par 
colmatage  latéral.  Deux  zones  sont  classiquement  distinguées  dans  les 
marais  maritimes :  la 

slikke

  (encore  dénommée  localement 

tidal  flats

wadden

  (au  sens  strict), 

tanguaie

,

  vasière 

selon  les  régions),  et  le 

schorre

(

salt marshes

herbus, mollières, 

ou

 pré-salé

).  

 
 

L’habitat  « schorre »  désigne  à  la  fois  une  couverture  végétale 

spécialisée  (plantes  halophiles)  et  le  substrat  sur  lequel  elle  se  développe. 
Ces deux entités indissociables forment un ensemble original qui occupe la 
frange supérieure de l’étage littoral. D’un point de vue écologique, il s’agit 
d’un espace amphibie, pouvant alternativement, partiellement ou totalement, 
selon  les  cycles  de  marée,  être  submergé  ou  émergé.  L’étendue  de  cette 
interface entre domaine terrestre et domaine marin est directement fonction 
de la morphologie locale de l’estran et de l’amplitude du marnage. 

 
Guilcher  (1954)  a  clairement  décrit  les  différents  éléments 

constitutifs de ces marais et distingue de bas en haut les éléments suivants :