ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 09.11.2023
Просмотров: 3143
Скачиваний: 364
ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.
Peter M. Visscher et al., «Five Years of GWAS Discovery», Американский журнал генетики человека , 90 (2012): 7-24. doi: 10.1016/j.ajhg.2011.11.029.
« Спустя еще пять лет, в 2017 году , количество значимых ассоциаций SNP для всего генома достигло 10 000» : Питер М. Висшер, «10 лет открытия GWAS: биология, функция и перевод», Американский журнал генетики человека , 101 (2017): 5–22. doi: 10.1016/j.ajhg.2017.06.005.
« Консорциум психиатрической геномики … в настоящее время включает более 800 исследователей из более чем 40 стран» : Джером Брин и др., «Перевод результатов общегеномных ассоциаций в новую терапию для психиатрии», Nature Neuroscience , 19 (2016): 1392- 6. doi: 10.1038/nn.4411. Наследуемость SNP и близнецовой предрасположенности составляет 30% и 80% для шизофрении, 25% и 90% для биполярного расстройства, 20% и 40% для большого депрессивного расстройства, 25% и 75% для гиперактивности и 20%. процентов и 90 процентов для аутизма . Эти наследуемые SNP взяты из: Cross-disorder Group of the Psychiatric Genomics Consortium, «Генетическая связь между пятью психическими расстройствами, оцененная на основе полногеномных SNP», Nature Genetics , 45 (2013): 984-94. doi: 10.1038/ng.2711. Наследуемость близнецовой ответственности взята из: Шизофрения : Патрик Ф. Салливан и др., «Шизофрения как комплексный признак — данные метаанализа исследований близнецов», Archives of General Psychiatry , 60 (2003): 1187-92. doi: 10.1001/archpsyc.60.12.1187. Биполярное расстройство
: Ник Крэддок и Памела Склар, «Генетика биполярного расстройства: успешное начало долгого пути», Trends in Genetics , 25 (2009): 99-105 . doi: 10.1016/j.tig.2008.12.002. Большое депрессивное расстройство : Патрик Ф. Салливан, Майкл С. Нил и Кеннет С. Кендлер, «Генетическая эпидемиология большой депрессии: обзор и метаанализ», Американский журнал психиатрии , 157 (2000): 1552-62. doi: 10.1176/appi.ajp.157.10.1552.
Гиперактивность : Стивен В. Фараоне и Эрик Мик, «Молекулярная генетика синдрома дефицита внимания с гиперактивностью», Психиатрические клиники Северной Америки , 33 (2010): 159-80. doi: 10.1016/j.psc.2009.12.004. Аутизм : Кристин М. Фрайтаг, «Генетика аутистических расстройств и ее клиническая значимость: обзор литературы», Молекулярная психиатрия , 12 (2007): 2-22. doi: 10.1007/s10803-017-3141-1.
' Отчет [ GWA ] за 2014 г. из PGC для шизофрении, включил 30 000 случаев и выявил более сотни значимых ассоциаций по всему геному »: Рабочая группа по шизофрении Консорциума психиатрической геномики, «Биологические данные из 108 связанных с шизофренией генетических локусов», Nature, 511 (2014) 421- 7. дои: 10.1038/nature13595.
К
2017 году PGC удвоился число случаев и увеличил количество ассоциаций до 155» : Патрик Салливан и др., «Психиатрическая геномика: обновление и повестка дня», Американский журнал психиатрии , 175 (2018) 15-27. doi: 10.1176/appi.ajp.2017.17030283.
' Для биполярного расстройства ... [t] количество значимых совпадений для всего генома увеличилось с нуля до тридцати » : Эли Шталь и др., «Полногеномное ассоциативное исследование идентифицирует 30 локусов, связанных с биполярным расстройством», bioRxiv (2017). дои: https://doi.org/10.1101/173062 .
« Большая депрессия закончилась с медленным началом, только с одним значительным попаданием в анализ GWA из 20 000 случаев »: Роберт А. Пауэр и др., «Полногеномная ассоциация большой депрессии через стратификацию возраста начала: рабочая группа по тяжелому депрессивному расстройству психиатрической геномики. Консорциум», Биологическая психиатрия , 81 (2017): 325-35. doi: 10.1016/j.biopsych.2016.05.010.
« В 2017 году PGC сообщила анализ GWA более 100 000 случаев, в результате которого было выявлено 44 значительных попадания» : Рабочая группа по тяжелому депрессивному расстройству PGC, «Полногеномный анализ ассоциации определяет 44 варианта риска и уточняет генетическую архитектуру большой депрессии», bioRxiv (2017). дои: 10.1101/167577. Напротив, в 2016 г. анализ 75 000 случаев выявил 15 значимых ассоциаций: Craig L. Hyde et al., «Идентификация 15 генетических локусов, связанных с риском глубокой депрессии у лиц европейского происхождения», Nature Genetics, 48 (
2016 ) : 1031-6. doi: 10.1038/ng.3623. Другое исследование GWA, в котором приняли участие 320 000 человек, добавило людей, которые просто сообщили, что обращались за помощью по поводу депрессии, и нашло 17 совпадений: Дэвид М. Ховард и др., «Ассоциативное исследование генома фенотипов депрессии в британском биобанке (n = 322 580) идентифицирует обогащение». вариантов возбуждающих синаптических путей», bioRxiv (2017). doi.org/10.1101/168732.
« Недавнее исследование гиперактивности GWA с 20 000 случаев сообщило о 12 совпадениях »: Ditte Demontis et al., «Открытие первых локусов значительного риска для всего генома для СДВГ», bioRxiv (2017). дои: https://doi.org/10.1101/145581 .
« В 1993 году. Было обнаружено, что аллель 4 АРОЕ тесно связана с болезнью Альцгеймера» : Элизабет Х. Кордер и др., «Генная доза аллеля аполипопротеина Е типа 4 и риск болезни Альцгеймера у
Late Onset Families', Science , 261 (1993), 921–923. doi
: 10.1126/science.8346443.
« Анализ болезни Альцгеймера, проведенный GWA в 2013 г. » : Жан-Шарль Ламберт и др., «Мета-анализ 74 046 человек выявил 11 новых локусов предрасположенности к болезни Альцгеймера», Nature Genetics , 45 (2013): 1452-8. doi: 10.1038/ng.2802.
« По психологическим расстройствам сообщалось о более чем сотне исследований GWA» : Jacqueline MacArthur et al., «Новый каталог NHGRI-EBI опубликованных полногеномных ассоциативных исследований (каталог GWAS)», Nucleic Acids Research , 45 (2017) : doi: 10.1093/нар/gkw1133. ' Размеры обеспечивают большую мощность в исследованиях GWA, чем расстройства, потому что каждый человек имеет значение» . Исследование GWA 50 000 неотобранных индивидуумов может дать возможность обнаружить ассоциацию SNP с признаком, на долю которого приходится 0,1% дисперсии признака. Например, объяснение 0,1 процента дисперсии стоит половины балла IQ в знакомой метрике интеллекта, состоящей из показателей IQ, которые стандартизированы так, чтобы иметь среднее значение 100 и диапазон от 55 до 145 для 99 процентов населения. Но даже этого крошечного эффекта в 0,1% недостаточно. Следующим барьером для преодоления будет 0,01-процентная величина эффекта (например, менее 0,05 балла IQ), для чего потребуются выборки из 500 000 человек. Образцы такого размера находятся в стадии разработки.
Достижение этой вершины в 500 000 человек, которая кажется нелепо большой для психологических исследований, только откроет другую, еще более высокую вершину. Для обнаружения еще меньших эффектов потребуются миллионы образцов.
« Спустя еще пять лет, в 2017 году , количество значимых ассоциаций SNP для всего генома достигло 10 000» : Питер М. Висшер, «10 лет открытия GWAS: биология, функция и перевод», Американский журнал генетики человека , 101 (2017): 5–22. doi: 10.1016/j.ajhg.2017.06.005.
« Консорциум психиатрической геномики … в настоящее время включает более 800 исследователей из более чем 40 стран» : Джером Брин и др., «Перевод результатов общегеномных ассоциаций в новую терапию для психиатрии», Nature Neuroscience , 19 (2016): 1392- 6. doi: 10.1038/nn.4411. Наследуемость SNP и близнецовой предрасположенности составляет 30% и 80% для шизофрении, 25% и 90% для биполярного расстройства, 20% и 40% для большого депрессивного расстройства, 25% и 75% для гиперактивности и 20%. процентов и 90 процентов для аутизма . Эти наследуемые SNP взяты из: Cross-disorder Group of the Psychiatric Genomics Consortium, «Генетическая связь между пятью психическими расстройствами, оцененная на основе полногеномных SNP», Nature Genetics , 45 (2013): 984-94. doi: 10.1038/ng.2711. Наследуемость близнецовой ответственности взята из: Шизофрения : Патрик Ф. Салливан и др., «Шизофрения как комплексный признак — данные метаанализа исследований близнецов», Archives of General Psychiatry , 60 (2003): 1187-92. doi: 10.1001/archpsyc.60.12.1187. Биполярное расстройство
: Ник Крэддок и Памела Склар, «Генетика биполярного расстройства: успешное начало долгого пути», Trends in Genetics , 25 (2009): 99-105 . doi: 10.1016/j.tig.2008.12.002. Большое депрессивное расстройство : Патрик Ф. Салливан, Майкл С. Нил и Кеннет С. Кендлер, «Генетическая эпидемиология большой депрессии: обзор и метаанализ», Американский журнал психиатрии , 157 (2000): 1552-62. doi: 10.1176/appi.ajp.157.10.1552.
Гиперактивность : Стивен В. Фараоне и Эрик Мик, «Молекулярная генетика синдрома дефицита внимания с гиперактивностью», Психиатрические клиники Северной Америки , 33 (2010): 159-80. doi: 10.1016/j.psc.2009.12.004. Аутизм : Кристин М. Фрайтаг, «Генетика аутистических расстройств и ее клиническая значимость: обзор литературы», Молекулярная психиатрия , 12 (2007): 2-22. doi: 10.1007/s10803-017-3141-1.
' Отчет [ GWA ] за 2014 г. из PGC для шизофрении, включил 30 000 случаев и выявил более сотни значимых ассоциаций по всему геному »: Рабочая группа по шизофрении Консорциума психиатрической геномики, «Биологические данные из 108 связанных с шизофренией генетических локусов», Nature, 511 (2014) 421- 7. дои: 10.1038/nature13595.
К
2017 году PGC удвоился число случаев и увеличил количество ассоциаций до 155» : Патрик Салливан и др., «Психиатрическая геномика: обновление и повестка дня», Американский журнал психиатрии , 175 (2018) 15-27. doi: 10.1176/appi.ajp.2017.17030283.
' Для биполярного расстройства ... [t] количество значимых совпадений для всего генома увеличилось с нуля до тридцати » : Эли Шталь и др., «Полногеномное ассоциативное исследование идентифицирует 30 локусов, связанных с биполярным расстройством», bioRxiv (2017). дои: https://doi.org/10.1101/173062 .
« Большая депрессия закончилась с медленным началом, только с одним значительным попаданием в анализ GWA из 20 000 случаев »: Роберт А. Пауэр и др., «Полногеномная ассоциация большой депрессии через стратификацию возраста начала: рабочая группа по тяжелому депрессивному расстройству психиатрической геномики. Консорциум», Биологическая психиатрия , 81 (2017): 325-35. doi: 10.1016/j.biopsych.2016.05.010.
« В 2017 году PGC сообщила анализ GWA более 100 000 случаев, в результате которого было выявлено 44 значительных попадания» : Рабочая группа по тяжелому депрессивному расстройству PGC, «Полногеномный анализ ассоциации определяет 44 варианта риска и уточняет генетическую архитектуру большой депрессии», bioRxiv (2017). дои: 10.1101/167577. Напротив, в 2016 г. анализ 75 000 случаев выявил 15 значимых ассоциаций: Craig L. Hyde et al., «Идентификация 15 генетических локусов, связанных с риском глубокой депрессии у лиц европейского происхождения», Nature Genetics, 48 (
2016 ) : 1031-6. doi: 10.1038/ng.3623. Другое исследование GWA, в котором приняли участие 320 000 человек, добавило людей, которые просто сообщили, что обращались за помощью по поводу депрессии, и нашло 17 совпадений: Дэвид М. Ховард и др., «Ассоциативное исследование генома фенотипов депрессии в британском биобанке (n = 322 580) идентифицирует обогащение». вариантов возбуждающих синаптических путей», bioRxiv (2017). doi.org/10.1101/168732.
« Недавнее исследование гиперактивности GWA с 20 000 случаев сообщило о 12 совпадениях »: Ditte Demontis et al., «Открытие первых локусов значительного риска для всего генома для СДВГ», bioRxiv (2017). дои: https://doi.org/10.1101/145581 .
« В 1993 году. Было обнаружено, что аллель 4 АРОЕ тесно связана с болезнью Альцгеймера» : Элизабет Х. Кордер и др., «Генная доза аллеля аполипопротеина Е типа 4 и риск болезни Альцгеймера у
Late Onset Families', Science , 261 (1993), 921–923. doi
1 ... 25 26 27 28 29 30 31 32 ... 35
: 10.1126/science.8346443.
« Анализ болезни Альцгеймера, проведенный GWA в 2013 г. » : Жан-Шарль Ламберт и др., «Мета-анализ 74 046 человек выявил 11 новых локусов предрасположенности к болезни Альцгеймера», Nature Genetics , 45 (2013): 1452-8. doi: 10.1038/ng.2802.
« По психологическим расстройствам сообщалось о более чем сотне исследований GWA» : Jacqueline MacArthur et al., «Новый каталог NHGRI-EBI опубликованных полногеномных ассоциативных исследований (каталог GWAS)», Nucleic Acids Research , 45 (2017) : doi: 10.1093/нар/gkw1133. ' Размеры обеспечивают большую мощность в исследованиях GWA, чем расстройства, потому что каждый человек имеет значение» . Исследование GWA 50 000 неотобранных индивидуумов может дать возможность обнаружить ассоциацию SNP с признаком, на долю которого приходится 0,1% дисперсии признака. Например, объяснение 0,1 процента дисперсии стоит половины балла IQ в знакомой метрике интеллекта, состоящей из показателей IQ, которые стандартизированы так, чтобы иметь среднее значение 100 и диапазон от 55 до 145 для 99 процентов населения. Но даже этого крошечного эффекта в 0,1% недостаточно. Следующим барьером для преодоления будет 0,01-процентная величина эффекта (например, менее 0,05 балла IQ), для чего потребуются выборки из 500 000 человек. Образцы такого размера находятся в стадии разработки.
Достижение этой вершины в 500 000 человек, которая кажется нелепо большой для психологических исследований, только откроет другую, еще более высокую вершину. Для обнаружения еще меньших эффектов потребуются миллионы образцов.