ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 09.11.2023
Просмотров: 3141
Скачиваний: 364
ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.
« Еще одним огромным преимуществом изучения размеров, а не расстройств, является то, что одна и та же выборка может быть использована для изучения многих признаков» . размеры.
Рост и вес являются архетипами количественных признаков. Оба имеют высокую наследуемость: 80% роста и 70% веса. Что касается роста, исследование GWA, в котором приняли участие более 250 000 человек, выявило 679 SNP, в значительной степени связанных с индивидуальными различиями в росте. Что касается веса, исследование GWA, в котором приняли участие более 300 000 человек, выявило 97 совпадений. Величина эффекта этих ассоциаций SNP ничтожно мала, за одним исключением. Что касается веса, то на один SNP приходится 1 процент дисперсии, что является самым большим эффектом, обнаруженным для любого количественного признака. Это SNP в гене FTO , описанный в предыдущей главе. Другие основные SNP для веса объясняют в среднем 0,03% различий между людьми в весе, что соответствует эффекту в 100 граммов. Рост показал несколько более сильные эффекты, хотя самый большой эффект SNP составил всего 0,28%. В среднем на верхние SNP приходится 0,07%, что соответствует влиянию роста на 0,05 см. Эндрю В. Вуд и др., «Определение роли общих вариаций в геномной и биологической архитектуре роста взрослого человека», Nature Genetics, 46 (2014): 1173-86. doi: 10.1038/ng.3097. Адам Э. Локк и др., «Генетические исследования индекса массы тела дают новое представление о биологии ожирения», Nature , 518 (2015): 197-U401. дои: 10.1038/природа14177.
« Первый прорыв был связан с маловероятной переменной: годами образования» : первое исследование GWA о годах обучения было опубликовано в 2013 году: Корнелиус А. Ритвельд и др., «GWAS 126 559 человек идентифицирует генетические варианты, связанные с уровнем образования».
Наука , 340 (2013): 1467-71. doi: 10.1126/наука.1235488. Исследование GWA было обновлено в 2016 году: Айсу Окбай и др., «Полногеномное исследование ассоциации идентифицирует 74 локуса, связанных с уровнем образования», Nature , 533 (2016): 539-42. doi: 10.1038/ng.3552. Следующее обновление будет включать в себя выборку размером более 1 миллиона, которая выявила более тысячи значимых ассоциаций: Джеймс Дж. Ли и др., «Открытие генов и полигенное предсказание на основе полногеномного исследования ассоциаций образовательных достижений в 1.1». Million Individual», Nature Genetics , онлайн-публикация Advance (2018). doi: 10.1038/s41588-018-0147-3.
« Многие психологические черты вносят свой вклад в эту наследуемость, например, предыдущие достижения в школе и когнитивные способности, которые коррелируют на 0,5 с количеством лет обучения» : Ева Краполь и др., «Высокая наследуемость образовательных достижений отражает многие генетически обусловленные черты, а не только интеллект. ', Труды Национальной академии наук США , 111 (2014): 15273-8. doi: 10.1073/pnas.1408777111.
« Что касается интеллекта, исследования GWA имели лишь скромный успех, пока размер выборки не достиг почти 300 000, когда в 2018 году было сообщено о более чем 200 значимых ассоциациях» . к полногеномным полигенным показателям: новая генетика интеллекта», Nature Reviews Genetics , 19 (2018): 148–159. doi: 10.1038/nrg.2017.104. Самое последнее исследование GWA с размером выборки почти 300 000 человек находится на рассмотрении: Дженнифер Э. Сэвидж и др., Метаанализ геномных ассоциаций у 269 867 человек идентифицирует новые генетические и функциональные связи с интеллектом», Nature Genetics, 50 (2018
) . ): 912-19. doi: 10.1038/s41588-018-0152-6.
' Что касается экстраверсии, исследование GWA из 100 000 человек нашли 5 совпадений»: Min-Tzu Lo et al., «Полногеномный анализ черт личности определяет шесть геномных локусов и показывает корреляцию с психическими расстройствами», Nature Genetics, 49 (2017): 152–156. doi: 10.1038/ng.3736.
« Что касается невротизма, в исследовании GWA с размером выборки 300 000 было зарегистрировано более 100 совпадений» : Мишель Лучано и др., «116 независимых генетических вариантов влияют на невротическую черту личности у более чем 329 000 человек из британского биобанка», bioRxiv (2017): дои: 10.1101/168906. Для благополучия ... исследование GWA, в котором приняли участие почти 200 000 человек человек нашли 3 совпадения : Айсу Окбай и др., «Генетические варианты, связанные с субъективным благополучием , депрессивными симптомами и невротизмом, выявленные с помощью полногеномного анализа», Nature Genetics , 48 (2016): 624-32. doi: 10.1038/ng.3552.
« Появляются исследования GWA других интересных личностных черт»: Варун Уорриер и др., «Полногеномный метаанализ когнитивной эмпатии: наследуемость и корреляция с полом, нейропсихиатрическими состояниями и анатомией мозга», bioRxiv ( 2017
) . дои: 10.1101/081844. Эми Э. Тейлор и Маркус Р. Мунафо. «Связи показателей генетического риска кофе с кофе, чаем и другими напитками в биобанке Великобритании», bioRxiv (2017). дои: 10.1101/096214. Жаклин М. Лейн и др., «Полгеномный ассоциативный анализ признаков нарушений сна, выявление новых локусов и выявление общей генетики с нейропсихиатрическими и метаболическими признаками», Nature Genetics , 49 (2016): 274-81. дои: 10.1038/ng.3749.
Винсент Дири и др., «Генетический вклад в самооценку усталости», Молекулярная психиатрия (2017). Предварительная онлайн-публикация. doi: 10.1038/mp.2017.5. Сэмюэл Э. Джонс и др., «Полногеномный анализ ассоциации у 128 266 человек выявил новые локусы утренней активности и продолжительности сна», PLoS Genetics , 12 (2016): e1006125. doi: 10.1371/journal.pgen.1006125.
« Полногеномное секвенирование — следующий большое дело в геномике» : Эрик Д. Грин и др., «Будущее секвенирования ДНК», Nature , 550 (2017): 179 81. doi: 10.1038/550179a.
« В ближайшие несколько лет у миллиарда людей будет секвенирован весь их геном, и эта информация о ДНК будет связана с электронными медицинскими записями» : Алкес Л. Прайс и др., «Прогресс и перспективы в понимании генетической основы распространенных заболеваний», Proceedings of the Royal Society B-Biological Sciences , 282 (2015): 2015–1684. doi: 10.1098/rspb.2015.1684. « Большинство генов влияют на большинство мозговых и поведенческих процессов
» : в недавней статье предполагается, что генетические эффекты не просто сильно полигенны — они «омнигенны» в том смысле, что большинство генов влияют на большинство черт: Evan A. Boyle et al., «An Расширенный взгляд на сложные признаки: от полигенности к омнигенности», Cell , 169 (2017): 1177-86. doi: 10.1016/j.cell.2017.05.038.
« Что мы знаем до сих пор, так это то, что некодирующие области могут быть вовлечены в регуляцию экспрессии генов» : гораздо труднее изучать экспрессию генов, чем унаследованные различия ДНК. Экспрессию генов, которая начинается с транскрипции ДНК в РНК, необходимо изучать в клетках определенных тканей (например, головного мозга) в определенном возрасте (например, внутриутробное развитие) в ответ на определенные условия окружающей среды (например, лекарства). Напротив, унаследованная последовательность ДНК одинакова во всех клетках любого возраста и во всех средах. Важно помнить, что все, что мы наследуем, — это последовательность ДНК. Эти унаследованные различия в последовательности ДНК ответственны за наследуемость. « Хотя эффекты отдельных SNP ничтожны, эти эффекты можно добавить, как мы добавляем элементы в тест, чтобы создать составную оценку… Я назвал эти наборы SNP » : Lee M. Butcher et al., «SNPs, Microarrays and Объединенная ДНК: идентификация четырех локусов, связанных с легким психическим расстройством, в образце из 6000 детей, Human Molecular Genetics , 14 (2005) : 1315-25. дои: 10.1093/hmg/ddi142.
-
Гадалка по ДНК
« После фальстарта исследований генов-кандидатов, которые не удалось воспроизвести, исследование GWA установило строгий критерий для сообщения о статистически значимых «попаданиях»