ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 09.11.2023
Просмотров: 3136
Скачиваний: 364
ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.
, 48 (2016): 1557-63. doi: 10.1038/ng.3708.
В большинстве случаев баллы большинства из нас будут близки к среднему показателю для населения. Средние оценки могут показаться разочаровывающими в том смысле, что они неоднозначны, ни рыба, ни мясо. Тем не менее, средние баллы могут быть лучшим результатом. Низкий полигенный балл расстройства может просто означать низкий риск, что звучит хорошо. Но полигенные баллы всегда нормально распределяются, и мы не знаем, что влечет за собой чрезвычайно низкий балл. Например, ревматоидный артрит — это аутоиммунное заболевание, которое может указывать на сверхактивную иммунную систему, которая воспринимает ваши собственные клетки как чужеродные. Очень низкий показатель полигенности может быть хорошим признаком, указывающим на то, что иммунная система менее склонна к перегрузке. Однако также возможно, что очень низкий показатель полигенности указывает на другие проблемы. Например, возможно, это указывает на менее чувствительную иммунную систему, которая может быть более уязвима для инфекции.
Что касается ревматоидного артрита, я был поражен, узнав, что моя полигенная оценка ревматоидного артрита находится на уровне 96-го процентиля. Ревматоидный артрит встречается в моей семье, и у меня начинают проявляться некоторые его признаки, особенно в коленях. Лучшая профилактическая мера отсрочить начало — бросить курить, но я никогда не курил. Следующая лучшая вещь — похудеть, так что это еще одна причина для меня усерднее стараться выиграть битву за лишние килограммы. Хотя я мало что могу с этим поделать, я все же предпочитаю знать, что может меня ожидать. Если бы я знал об этом риске раньше, стал бы я меньше играть в сквош, баскетбол и волейбол, которые тяжелы для коленей? Если бы убедительные научные данные говорили мне, что это имеет значение, я бы, вероятно, выбрал более приятный вид спорта для коленей. Но таких доказательств пока нет. Теперь, когда мы можем прогнозировать генетический риск в раннем возрасте, у науки будет больше шансов выяснить, как предотвратить эти проблемы. Профилактика намного лучше, чем попытки вылечить эти сложные расстройства после их возникновения. Моя полигенная оценка ревматоидного артрита была основана на результатах анализа GWA, который включал 30 000 случаев ревматоидного артрита и сообщал о 101 значимой ассоциации: Yukinori Okada et al., 'Genetics of Rheumatoid Arthritis Contributes to Biology and Drug Discovery', Nature, 506
( 2014): 376-81. дои: 10.1038/nature12873.
Моя полигенная оценка также была высокой (87-й процентиль) для чувствительности к инсулину, но это хорошо, потому что считается, что он защищает от диабета, хотя он также может затруднить похудение.
Моя полигенная оценка чувствительности к инсулину была основана на результатах анализа GWA 17 000 человек, которые сообщили о 23 значимых ассоциациях: Джеффри А. Уолфорд и др., «Полногеномное ассоциативное исследование модифицированного индекса чувствительности Стамволла к инсулину идентифицирует BCL2 и FAM19A2 как новые Insulin Sensitivity Loci', Diabetes, 65 (2016): 3200 211. doi: 10.2337/db16-0199.
Другой интересной для меня медицинской полигенной шкалой была мигрень. Моя полигенная оценка находится на 83-м процентиле. У меня были мигрени с аурой, визуальные симптомы, возникающие непосредственно перед началом мигрени. К счастью, я сталкивался с ними всего пару раз в год в подростковом и юношеском возрасте. Теперь они у меня редко бывают, хотя я могу подвергнуть себя риску, слишком долго глядя на экран компьютера, а появление ауры дает полезный сигнал о том, что пора выключать инструменты. Мы создали полигенные оценки на основе исследования GWA 375 000 случаев, в котором сообщалось о 38 значимых ассоциациях: Padhraig Gormley et al., «Мета-анализ 375 000 человек идентифицирует 38 локусов предрасположенности к мигрени», Nature Genetics, 48 (2016): 856-66 . doi: 10.1038/ng.3598.
« Для шизофрении полигенные оценки в настоящее время могут предсказать 7% дисперсии предрасположенности к диагнозу шизофрении» : Stephan Ripke et al., «Biological Insights from 108 Schizophrenia-associated Genetic Loci», Nature , 511 (2014), 421-7. дои: 10.1038/nature13595. Во фразе «изменение ответственности» есть ловушка. Анализ GWA диагностированных расстройств основан на сравнении людей с диагнозом расстройства (называемых случаями) с контрольной группой, у которой расстройство не было диагностировано. Это затрудняет обсуждение дисперсии, предсказываемой полигенной оценкой, потому что все, что анализируется, — это средняя разница частоты SNP между случаями и контролем. Эту проблему можно обойти статистически, если предположить, что существует континуум ответственности, лежащий в основе дихотомии между случаями и контролем. Модель предполагает, что люди диагностируются как случаи, когда они пересекают определенный порог серьезности в континууме ответственности. Это называется
моделью порога ответственности .
Проблема с этой моделью заключается в том, что одно из «больших открытий» поведенческой генетики состоит в том, что расстройства — это просто крайности одних и тех же генетических факторов, действующих в пределах нормального распределения. Никаких нарушений, только размеры. С этой точки зрения кажется неправильным оценивать дихотомическое расстройство (случаи против контроля), а затем предполагать, что это непрерывное измерение.
Но модель порога ответственности разумна, если мы рассматриваем расстройства как количественные крайности нормального распределения. Продолжая крайний пример «гигантизма», использованный ранее, мы как будто взяли непрерывную характеристику, такую как рост, и сосредоточились на «диагностике» гигантов, которые находятся в верхнем 1 проценте роста. Предположим, мы провели GWA-исследование случай-контроль гигантов по сравнению с остальной популяцией, отбросив всю информацию об индивидуальных различиях в росте остальной популяции. Основываясь на выводах о том, что расстройства — это просто предельные размеры, результаты исследования GWA гигантов по сравнению с контрольной группой должны быть аналогичны результатам исследования GWA индивидуальных различий в росте во всей популяции. Но зачем сравнивать гигантов с остальным населением, если рост — это явно непрерывная черта? Это не имеет смысла. Вот как я думаю обо всех расстройствах — они просто количественные крайности непрерывных черт.
Для таких расстройств, как большое депрессивное расстройство, а также таких параметров, как рост, полигенные баллы совершенно нормально распределяются в виде колоколообразных кривых. Я предсказываю, что полигенные оценки забьют больше гвоздей в гроб диагностических дихотомий. Если генетический вклад в расстройства распределяется нормально, это означает, что с генетической точки зрения расстройств нет, есть только измерения. Стоит повторить: генетические различия между людьми с диагнозом расстройства и остальным населением количественные, а не качественные. Не существует порога, при котором генетический риск превращается в диагностируемое заболевание. Для непрерывных размеров вполне разумно сосредоточиться на крайних значениях, потому что именно здесь возникают наиболее серьезные проблемы. Но нет этиологически определенного расстройства, есть только непрерывное измерение.
Эта полигенная шкала для шизофрении уже предсказывает большую дисперсию ответственности, чем переменные, традиционно используемые для прогнозирования риска шизофрении : Evangelos Vassos et al., 'An Examination of Polygenic Score Risk Prediction in Individuals with First-episode Psychosis', Biological Psychiatry, 81 ( 2017): 470-77. doi: 10.1016/j.biopsych.2016.06.028.
« По сравнению с шизофренией современные полигенные шкалы для большого депрессивного расстройства и биполярного расстройства предсказывают меньшую дисперсию ответственности — 1 процент для большого депрессивного расстройства и 3 процента для биполярного расстройства» : Naomi R. Wray et al., «Полногеномная ассоциация». Анализы определяют 44 варианта риска и уточняют генетическую архитектуру глубокой депрессии»,
Nature Genetics . Предварительная онлайн-публикация. doi: 10.1038/s41588-018-0090-3.
« Моя относительно высокая полигенная оценка шизофрении заставляет меня еще меньше, чем обычно, хотеть пробовать новые формы каннабиса с высоким содержанием ТГК, которые были связаны с началом шизофрении» : Луиза Арсено и др., «Употребление каннабиса в подростковом возрасте и Риск развития психоза у взрослых: долгосрочное перспективное исследование», British Medical Journal , 325 (2002): 1212-13. doi: 10.1136/bmj.325.7374.1212.
« Недиагностированные родственники шизофреников первой степени родства чаще занимались творческими профессиями, такими как актеры, музыканты и писатели» : Саймон Кьяга и др., «Психическое заболевание, самоубийство и творчество: 40-летнее проспективное исследование общей популяции» , Journal of Psychiatric Research , 47 (2013): 83 90. doi: 10.1016/j.jpsychires.2012.09.010.
« Люди с высокими полигенными показателями шизофрении с большей вероятностью занимались творческими профессиями» : Роберт А. Пауэр и др., «Полигенные показатели риска шизофрении и биполярного расстройства предсказывают креативность», Nature Neuroscience , 18 (2015): 953–955. . doi: 10.1038/nn.4040.
' Единственный конкретный совет было бы избегать травм головы - определенно не заниматься боксом и, вероятно, не играть в футбол головой - потому что травма головы является одним из факторов окружающей среды, который, как известно, увеличивает риск болезни Альцгеймера»
В большинстве случаев баллы большинства из нас будут близки к среднему показателю для населения. Средние оценки могут показаться разочаровывающими в том смысле, что они неоднозначны, ни рыба, ни мясо. Тем не менее, средние баллы могут быть лучшим результатом. Низкий полигенный балл расстройства может просто означать низкий риск, что звучит хорошо. Но полигенные баллы всегда нормально распределяются, и мы не знаем, что влечет за собой чрезвычайно низкий балл. Например, ревматоидный артрит — это аутоиммунное заболевание, которое может указывать на сверхактивную иммунную систему, которая воспринимает ваши собственные клетки как чужеродные. Очень низкий показатель полигенности может быть хорошим признаком, указывающим на то, что иммунная система менее склонна к перегрузке. Однако также возможно, что очень низкий показатель полигенности указывает на другие проблемы. Например, возможно, это указывает на менее чувствительную иммунную систему, которая может быть более уязвима для инфекции.
Что касается ревматоидного артрита, я был поражен, узнав, что моя полигенная оценка ревматоидного артрита находится на уровне 96-го процентиля. Ревматоидный артрит встречается в моей семье, и у меня начинают проявляться некоторые его признаки, особенно в коленях. Лучшая профилактическая мера отсрочить начало — бросить курить, но я никогда не курил. Следующая лучшая вещь — похудеть, так что это еще одна причина для меня усерднее стараться выиграть битву за лишние килограммы. Хотя я мало что могу с этим поделать, я все же предпочитаю знать, что может меня ожидать. Если бы я знал об этом риске раньше, стал бы я меньше играть в сквош, баскетбол и волейбол, которые тяжелы для коленей? Если бы убедительные научные данные говорили мне, что это имеет значение, я бы, вероятно, выбрал более приятный вид спорта для коленей. Но таких доказательств пока нет. Теперь, когда мы можем прогнозировать генетический риск в раннем возрасте, у науки будет больше шансов выяснить, как предотвратить эти проблемы. Профилактика намного лучше, чем попытки вылечить эти сложные расстройства после их возникновения. Моя полигенная оценка ревматоидного артрита была основана на результатах анализа GWA, который включал 30 000 случаев ревматоидного артрита и сообщал о 101 значимой ассоциации: Yukinori Okada et al., 'Genetics of Rheumatoid Arthritis Contributes to Biology and Drug Discovery', Nature, 506
( 2014): 376-81. дои: 10.1038/nature12873.
Моя полигенная оценка также была высокой (87-й процентиль) для чувствительности к инсулину, но это хорошо, потому что считается, что он защищает от диабета, хотя он также может затруднить похудение.
Моя полигенная оценка чувствительности к инсулину была основана на результатах анализа GWA 17 000 человек, которые сообщили о 23 значимых ассоциациях: Джеффри А. Уолфорд и др., «Полногеномное ассоциативное исследование модифицированного индекса чувствительности Стамволла к инсулину идентифицирует BCL2 и FAM19A2 как новые Insulin Sensitivity Loci', Diabetes, 65 (2016): 3200 211. doi: 10.2337/db16-0199.
Другой интересной для меня медицинской полигенной шкалой была мигрень. Моя полигенная оценка находится на 83-м процентиле. У меня были мигрени с аурой, визуальные симптомы, возникающие непосредственно перед началом мигрени. К счастью, я сталкивался с ними всего пару раз в год в подростковом и юношеском возрасте. Теперь они у меня редко бывают, хотя я могу подвергнуть себя риску, слишком долго глядя на экран компьютера, а появление ауры дает полезный сигнал о том, что пора выключать инструменты. Мы создали полигенные оценки на основе исследования GWA 375 000 случаев, в котором сообщалось о 38 значимых ассоциациях: Padhraig Gormley et al., «Мета-анализ 375 000 человек идентифицирует 38 локусов предрасположенности к мигрени», Nature Genetics, 48 (2016): 856-66 . doi: 10.1038/ng.3598.
-
Предсказать, кто мы
« Для шизофрении полигенные оценки в настоящее время могут предсказать 7% дисперсии предрасположенности к диагнозу шизофрении» : Stephan Ripke et al., «Biological Insights from 108 Schizophrenia-associated Genetic Loci», Nature , 511 (2014), 421-7. дои: 10.1038/nature13595. Во фразе «изменение ответственности» есть ловушка. Анализ GWA диагностированных расстройств основан на сравнении людей с диагнозом расстройства (называемых случаями) с контрольной группой, у которой расстройство не было диагностировано. Это затрудняет обсуждение дисперсии, предсказываемой полигенной оценкой, потому что все, что анализируется, — это средняя разница частоты SNP между случаями и контролем. Эту проблему можно обойти статистически, если предположить, что существует континуум ответственности, лежащий в основе дихотомии между случаями и контролем. Модель предполагает, что люди диагностируются как случаи, когда они пересекают определенный порог серьезности в континууме ответственности. Это называется
моделью порога ответственности .
Проблема с этой моделью заключается в том, что одно из «больших открытий» поведенческой генетики состоит в том, что расстройства — это просто крайности одних и тех же генетических факторов, действующих в пределах нормального распределения. Никаких нарушений, только размеры. С этой точки зрения кажется неправильным оценивать дихотомическое расстройство (случаи против контроля), а затем предполагать, что это непрерывное измерение.
Но модель порога ответственности разумна, если мы рассматриваем расстройства как количественные крайности нормального распределения. Продолжая крайний пример «гигантизма», использованный ранее, мы как будто взяли непрерывную характеристику, такую как рост, и сосредоточились на «диагностике» гигантов, которые находятся в верхнем 1 проценте роста. Предположим, мы провели GWA-исследование случай-контроль гигантов по сравнению с остальной популяцией, отбросив всю информацию об индивидуальных различиях в росте остальной популяции. Основываясь на выводах о том, что расстройства — это просто предельные размеры, результаты исследования GWA гигантов по сравнению с контрольной группой должны быть аналогичны результатам исследования GWA индивидуальных различий в росте во всей популяции. Но зачем сравнивать гигантов с остальным населением, если рост — это явно непрерывная черта? Это не имеет смысла. Вот как я думаю обо всех расстройствах — они просто количественные крайности непрерывных черт.
Для таких расстройств, как большое депрессивное расстройство, а также таких параметров, как рост, полигенные баллы совершенно нормально распределяются в виде колоколообразных кривых. Я предсказываю, что полигенные оценки забьют больше гвоздей в гроб диагностических дихотомий. Если генетический вклад в расстройства распределяется нормально, это означает, что с генетической точки зрения расстройств нет, есть только измерения. Стоит повторить: генетические различия между людьми с диагнозом расстройства и остальным населением количественные, а не качественные. Не существует порога, при котором генетический риск превращается в диагностируемое заболевание. Для непрерывных размеров вполне разумно сосредоточиться на крайних значениях, потому что именно здесь возникают наиболее серьезные проблемы. Но нет этиологически определенного расстройства, есть только непрерывное измерение.
Эта полигенная шкала для шизофрении уже предсказывает большую дисперсию ответственности, чем переменные, традиционно используемые для прогнозирования риска шизофрении : Evangelos Vassos et al., 'An Examination of Polygenic Score Risk Prediction in Individuals with First-episode Psychosis', Biological Psychiatry, 81 ( 2017): 470-77. doi: 10.1016/j.biopsych.2016.06.028.
« По сравнению с шизофренией современные полигенные шкалы для большого депрессивного расстройства и биполярного расстройства предсказывают меньшую дисперсию ответственности — 1 процент для большого депрессивного расстройства и 3 процента для биполярного расстройства» : Naomi R. Wray et al., «Полногеномная ассоциация». Анализы определяют 44 варианта риска и уточняют генетическую архитектуру глубокой депрессии»,
1 ... 27 28 29 30 31 32 33 34 35
Nature Genetics . Предварительная онлайн-публикация. doi: 10.1038/s41588-018-0090-3.
« Моя относительно высокая полигенная оценка шизофрении заставляет меня еще меньше, чем обычно, хотеть пробовать новые формы каннабиса с высоким содержанием ТГК, которые были связаны с началом шизофрении» : Луиза Арсено и др., «Употребление каннабиса в подростковом возрасте и Риск развития психоза у взрослых: долгосрочное перспективное исследование», British Medical Journal , 325 (2002): 1212-13. doi: 10.1136/bmj.325.7374.1212.
« Недиагностированные родственники шизофреников первой степени родства чаще занимались творческими профессиями, такими как актеры, музыканты и писатели» : Саймон Кьяга и др., «Психическое заболевание, самоубийство и творчество: 40-летнее проспективное исследование общей популяции» , Journal of Psychiatric Research , 47 (2013): 83 90. doi: 10.1016/j.jpsychires.2012.09.010.
« Люди с высокими полигенными показателями шизофрении с большей вероятностью занимались творческими профессиями» : Роберт А. Пауэр и др., «Полигенные показатели риска шизофрении и биполярного расстройства предсказывают креативность», Nature Neuroscience , 18 (2015): 953–955. . doi: 10.1038/nn.4040.
' Единственный конкретный совет было бы избегать травм головы - определенно не заниматься боксом и, вероятно, не играть в футбол головой - потому что травма головы является одним из факторов окружающей среды, который, как известно, увеличивает риск болезни Альцгеймера»