ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 01.12.2019
Просмотров: 3399
Скачиваний: 3
Механизм взаимодействия факторов регуляции транскрипции с ДНК-зависимыми РНК-полимеразами и промоторными участками генов остается одной из ключевых и все еще недостаточно изученных проблем функционирования генома клеток. Особенно скудна информация, касающаяся растительных объектов.
Мутации в генах, кодирующих факторы регуляции транскрипции у животных, могут привести к определенным заболеваниям [Latchman, 1997].
У растений описаны представители семейства генов, кодирующих факторы регуляции транскрипции [Aso et al., 1999] с лейциновыми "застежками-молниями". Было показано, что транскрипционные факторы этого типа отвечают за салицилатиндуцированное образование защитных антипатогенных белков и что мутации в указанных генах приводят к потере способности синтезировать эти белки [Zhang et al., 1999].
ПРОМОТОРЫ ГЕНОВ БЕЛКОВ СИГНАЛЬНЫХ СИСТЕМ И ЗАЩИТНЫХ БЕЛКОВ
В настоящее время интенсивно исследуется структура промоторных участков генов, отвечающих за приобретение иммунитета к различным патогенам. Уже давно привлекает внимание факт практически одновременного синтеза целого ряда патогениндуцируемых белков: Это может быть вызвано как дивергенцией сигнальных путей в одной сигнальной системе, что обусловливает активацию нескольких типов факторов регуляции транскрипции, так и "включением" тем или иным элиситором нескольких сигнальных систем, которые, функционируя параллельно, активируют несколько типов факторов регуляции транскрипции и, вследствие этого, вызывают экспрессию нескольких видов защитных белков. Не исключена также возможность того, что промоторы генов нескольких индивидуальных белков имеют одну и ту же структуру регуляторных элементов, что приводит к их одновременной экспрессии даже в случае сигнальной активации одного представителя факторов регуляции транскрипции.1
Последний вариант имеет место при действии на растения стрессового фитогормона этилена, когда фактор регуляции транскрипции взаимодействует с GCC-боксом промоторных участков нескольких этилениндуцируемых генов, что обеспечивает более или менее одновременное образование целой группы этилениндуцируемых белков [Thara et al., 1999]. Такой принцип пакетного синтеза защитных белков реализуется при ответе клеток на различные стрессоры или элиситоры (к вторичным элиситорам можно отнести и стрессовые фитогормоны). Например, при действии повышенных температур индуцируется транскрипция группы генов, содержащих в промоторных участках общий регуля-
торный элемент HSE (heat shock element), отсутствующий у других генов [Latchman, 1997]. Эта закономерность была подтверждена с помощью приема создания гибридных генов с промотором гена теплового шока, состыкованного с другим геном, обычно не изменяющим интенсивности экспрессии при действии повышенных температур. В случае же трансгенных растений начиналась его экспрессия. В эукариотических клетках обнаружены также промоторные участки со сходными последовательностями нуклеотидов у различных генов, индуцируемых одним и тем же интерме-диатом (вторичным посредником) сигнальных систем, например циклическим АМФ. В последнем случае сигнальная последовательность нуклеотидов промоторного участка имеет обозначение CRE (cyclic AMP response element).
У арабидопсиса обнаружена глюкокортикоидная система активации факторов регуляции транскрипции, включение которой приводило к экспрессии патогениндуцируе-мых защитных генов [Н. Kang et al., 1999]. Распространенными последовательностями нуклеотидов в G-боксе промоторов были CCACGTGG, а в С-боксе - TGACGTCA [Niu et al., 1999].
Вирус табачной мозаики и салициловая кислота вызывали у растений табака индукцию двух генов факторов регуляции транскрипции класса WRKY, узнающих в промо-торных участках защитных генов определенную последовательность нуклеотидов - TTGAC (W-box). Активация этих факторов регуляции транскрипции осуществлялась с помощью их фосфорилирования протеинкиназами [Chen, Chen, 2000]. Все белки класса WRKY, в отличие от других классов транскрипционных факторов (таких, как bZIP и myb), имеют консервативный домен, содержащий гептамерный пептид WRKYGQK [Rushton, Somssich, 1998].
( Один из доменов фактора регуляции транскрипции, отвечающего за преобразование жасмонатного сигнала, активирует регуляторный участок промотора нескольких генов, кодирующих жасмонат- и элиситор-индуцируемые белки, в частности стриктозидин-синтазу [Van der Fits, Memelink, 2001]. Оказалось, что активирующим действием обладает N-концевой кислый домен фактора регуляции транскрипции, а обогащенный остатками серина С-концевой домен -I ингибирующим.
Показано, что промотор гена фенилаланин-аммиак-лиа-зы (важнейшего стартового фермента разветвленного метаболического процесса синтеза соединений, играющих защитную роль, - салицилата, фенольных кислот, фенилпро-паноидных фитоалексинов и лигнина) содержит по две копии обогащенных АС-повторами участков [Gray-Mitsumune ctal., 1999].
При изучении промотора гена другого фермента синте-ia фитоалексинов - халконсинтазы, у культуры клеток бобов, табака и риса было обнаружено, что в активации промотора принимают участие G-бокс (CACGTG) в области от -74 до -69 пар нуклеотидов и Н-боксы (ССТАСС) в области от -61 до -56 и от -126 до -121 пар нуклеотидов [Arias et al., 1993].
В других опытах было выяснено, что при действии эли-ситоров экспрессия гена халконсинтазы у растений гороха зависит от области промотора от -242 до -182 пар нуклеотидов, в которой два участка содержат идентичные AT последовательности -ТААААТАСТ-, причем одна из них, располагающаяся в области от -242 до -226, была необходима для проявления максимальной активности гена [Seki et al., 1996].
Промотор гена стриктозидин-синтазы, одного из ключевых элиситориндуцируемых ферментов синтеза терпе-ноидных фитоалексинов, имеет активируемую факторами регуляции транскрипции область от -339 до -145 пар нуклеотидов [Memelink et al., 1999]. G-бокс, расположенный вблизи -105 пары нуклеотидов, не влиял на активность промотора.
При исследовании активности гена |3-1,3-глюканазы у растений табака было обнаружено, что она зависит от области промотора от -250 до -217 пар нуклеотидов, содержащей последовательность -GGCGGC-, характерную для промоторов генов, кодирующих патогениндуцируемые щелочные белки [Alonso et al., 1995].
Так называемый PR-бокс промоторных участков многих патогениндуцируемых белков содержит последовательность (5'-AGCCGCC-3'), с которой связываются соответствующие факторы регуляции транскрипции, что приводит к экспрессии генов этих белков, в частности эндохитиназ и Р-1,3-глюканаз у растений томатов [Jia, Martin, 1999].
Многие гены патогениндуцируемых белков содержат в промоторах так называемые ocs-элементы, с которыми взаимодействуют факторы регуляции транскрипции, имеющие в своей структуре лейциновые застежки-молнии. У растений арабидопсиса факторы регуляции транскрипции, ответственные за преобразование этиленового сигнала, связываются и с GCC-боксом и с ocs-элементами промоторов, что приводит к экспрессии целого ряда защитных белков [Buttner, Singh, 1997].
Исследование трансгенных растений табака с промотором щелочной хитиназы и репортерным геном GUS позволило установить, что активируемая этиленовым сигналом область промотора находится между -503 и -358 парами ну-клеотидов, где имеются две копии GCC-бокса (5'-TAAGAGCCGCC-3') [Shinshi et al., 1995], который характерен для промоторов многих этилениндуцируемых белков. Дальнейший анализ показал, что ответственный за реакцию на этилен участок промотора с двумя копиями GCC-бокса расположен между -480 и —410 парами нуклеотидов.
При исследовании реакции растений табака на обработку этиленом и инфицирование вирусом мозаики было обнаружено, что активность промотора гена (3-1,3-глюканазы зависит от области, расположенной между -1452 и -1193 парами нуклеотидов, где имеются две копии гептануклеотида 5-AGCCGCC-3' [Vogeli-Lange et al., 1994]. Найдены и дополнительные области, существенные для регуляции активности промотора.
Рассмотренные выше элиситоры, рецепторы элисито-ров, G-белки, протеинкиназы, протеинфосфатазы, факторы регуляции транскрипции, соответствующие им промотор-ные участки генов принимают участие в функционировании целого ряда сигнальных систем клеток, от которых зависит их реакция на сигналы различной природы и интенсивности: аденилатциклазной, МАР-киназной, фосфатидатной, кальциевой, липоксигеназной, НАДФН-оксидазной, NO-синтазной и протонной.
АДЕНИЛАТЦИКЛАЗНАЯ СИГНАЛЬНАЯ СИСТЕМА
Эта сигнальная система получила свое название по впервые охарактеризованному Сазерлендом [Sutherland, 1962] ферменту аденилатциклазе, катализирующей образование основного сигнального интермедиата этой системы - циклического аденозинмонофосфата (цАМФ). Схема аденилатциклазной системы такова: внешний химический сигнал, например гормон или элиситор, взаимодействует с белком-рецептором плазмалеммы, что приводит к активации G-белка (связывания им ГТФ) и передаче сигнального импульса на фермент аденилатциклазу (АЦ), который катализирует синтез цАМФ из АТФ (рис. 6).
В аденилатциклазной системе различают Gs-белки, стимулирующие аденилатциклазу, и (5,-белки, тормозящие активность фермента. Различия между этими двумя видами белков определяются в основном особенностями ос-субъ-единиц, а не (3- и у-субъединиц. Молекулярные массы ocs-субъединиц G-белка равны 41-46 кДа, агсубъединиц -40-41 кДа, (3,- и Р2-субъединиц - 36-35 кДа, у-субъединиц -8-10 кДа. Связывание G-белками ГТФ и его гидролиз до ГДФ и неорганического ортофосфата обеспечивают обратимость процессов активации аденилатциклазы [Gilman, 1987].
Аденилатциклаза является мономерным интегральным белком плазматической мембраны и поэтому с трудом поддается экстракции и переходу в растворимую форму. Молекулярная масса аденилатциклазы клеток животных равна 120-155 кДа; имеются также растворимые формы аденилатциклазы 50-70 кДа, не чувствительные к кальмодулину и G-белкам [Ichikawa et al., 1997]. У растений молекулярная масса аденилатциклазы составляет 84 кДа. Кривая зависимости активности аденилатциклазы от рН имела одновершинный характер, причем пик активности для этого фер-